Question

当我正在玩我的计算机群集时，我正在尝试开发一些脚本来帮助我保持群集上的计算机同步，就包，版本等而言，而不是登录到每台计算机并更新所有包，我想通过SSH运行系统调用。但是，我似乎无法正确地进行系统调用。这是我正在尝试做的一个例子。

system(paste0("C:/PuTTY/plink.exe [SSH stuff] ",
              "RScript -e ",
              "install.packages(", shQuote("HydeNet"), 
              ", repos = ",
              shQuote("http://mirrors.nics.utk.edu/cran/"),
              ")"))

理想情况下，这会在远程计算机上安装HydeNet包。我一直得到这个回报：

Error: unexpected end of input
Execution halted
Warning message:
running command 'RScript -e install.packages("HydeNet", repos = "http://mirrors.nics.utk.edu/cran/")' had status 1

在我看来，这是一个不匹配的引号字符，或不匹配的括号，但我只是看不到不匹配。我已经尝试了我能想到的单引号和双引号的每一种排列。我还没有想到什么？

Answer 1

您是否先在当地尝试过该命令？

Rscript的语法为Rscript -e "expression in quotes"

看起来像install.packages中的Rscript期望包名称和repo用单引号。

使用此命令

system(paste0("C:/PuTTY/plink.exe [SSH stuff] ",
       "RScript -e ","\"install.packages(", shQuote("'HydeNet'"), 
       ",repos = ",shQuote("'http://mirrors.nics.utk.edu/cran/'"),")\""))

使用system在远程计算机上运行install.packages

1 个答案: