我可以找到生物信息学相关工具here。该工具可以从that page下的链接下载。
这是一个Java打包文件,我可以在Windows上运行它
使用以下命令行编译的版本(请参阅自述文件,需要将Mold2.doc
的名称更改为Mold2.exe
):
Mold2 -i TestCompounds.sdf
(我已将TestCompounds.sdf
文件移动到与该exe文件相同的路径上)
它会生成一些消息并输出2个文件output.txt
和report.txt
。
问题是此软件包没有任何适用于Mac OS的预编译版本可执行文件。
然而,由于Java应该是跨平台的,因为我也有java Mold2.jar文件,我认为如果我可以在Mac OS下执行它对我有用。但我可以找到如何做到的方式......
我尝试过:
java -cp Mold2.jar Mold2
但是它只调用GUI,我找不到如何在终端下只使用参数执行这个程序而不调用GUI,这就是我想要的集成目的。
那么如何在终端上的Mac OS上运行此工具呢?