Question

如果我有一个MPI程序，我想用gdb调试，同时能够看到所有单独的进程＆＃39;输出，我可以使用：

mpirun -n <NP> xterm -hold -e gdb -ex run --args ./program [arg1] [arg2] [...]

当我有一个GUI可以使用时，这是很好的。但情况并非总是如此。

我可以使用screen进行类似设置，以便每个进程都有自己的窗口吗？这对于在远程环境中进行调试很有用，因为它允许我使用Ctrl+a n在输出之间切换。

Answer 1

我认为this在“我如何调试MPI程序？”中回答。线程做你想要的。

编辑：

在回应评论时，你可以更容易地做到这一点，虽然简洁不完全是我将使用的术语：

通过mpirun启动分离屏幕 - 运行调试器和进程。我已经调用了会话mpi，我通过我的库路径，因为它被屏幕剥离，我的演示需要它（我也在Mac上，因此lldb和DYLD）：

mpirun -np 4 screen -AdmS mpi env DYLD_LIBRARY_PATH=$DYLD_LIBRARY_PATH lldb demo.out

然后启动一个单独的屏幕会话，我称之为'debug'：

screen -AdmS debug

使用screen -ls列出正在运行的会话：

＆GT;＆GT;屏幕-ls

屏幕上有：

19871.mpi（独立）

19872.mpi（独立）

19875.mpi（独立）

19876.mpi（独立）

20105.debug（独立）

现在在调试会话中启动4个新选项卡，将每个选项卡附加到其中一个mpi会话：

screen -S debug -X screen -t tab0 screen -r 19871.mpi
screen -S debug -X screen -t tab1 screen -r 19872.mpi
screen -S debug -X screen -t tab2 screen -r 19875.mpi
screen -S debug -X screen -t tab3 screen -r 19876.mpi

然后只需使用screen -r debug附加到调试会话即可。现在你有4个选项卡，每个选项卡都运行一个连接到mpi进程的调试器的串行实例，类似于你之前描述的xterm方法。它不是最快的命令集，但至少你不需要修改你的代码或追逐PID等。

我试过的另一种方法，但似乎不起作用：

启动分离的屏幕

screen -AdmS ashell

启动两个mpi进程，在分离的会话中启动新的屏幕选项卡，使用我的demo mpi应用程序启动lldb：

mpirun -np 1 screen -S ashell -X screen -t tab1 env DYLD_LIBRARY_PATH=$DYLD_LIBRARY_PATH lldb demo.out : -np 1 screen -S ashell -X screen -t tab2 env DYLD_LIBRARY_PATH=$DYLD_LIBRARY_PATH lldb demo.out

或者只是

mpirun -np 2 screen -S ashell -X screen env DYLD_LIBRARY_PATH=$DYLD_LIBRARY_PATH lldb demo.out

然后用

附加到屏幕

screen -r ashell

你将有3个标签，其中2个用你的程序运行lldb，另一个用你的标准shell。不幸的是，当你尝试运行这些程序时，每个进程都认为它是通用世界中唯一的进程，并且我不知道该怎么办...

Answer 2

如何调试C / C ++ MPI程序？

一种方法是为每个开始一个单独的终端和gdb会话过程：

mpirun -n <NP> xterm -hold -e gdb -ex run --args ./program [arg1] [arg2] [...]

其中NP是进程数。

如果您没有方便的GUI会怎样？

（请参阅下面的一个方便的脚本。）

这是基于timofiend的回答here。

在许多屏幕会话中调试其调试器中的mpi程序：

mpirun -np 4 screen -AdmS mpi gdb ./parallel_pit_fill.exe one retain ./beauford.tif 500 500

启动新的屏幕会话以访问调试器：

screen -AdmS debug

将调试器的屏幕会话加载到新的屏幕会话

screen -list |                   #Get list of screen sessions
   grep -E "[0-9]+.mpi"  |       #Extract the relevant ones
   awk '{print NR-1,$1}' |       #Generate tab #s and session ids, drop rest of the string
   xargs -n 2 sh -c '
     screen -S debug -X screen -t tab$0 screen -r $1
   '

跳转到新的屏幕会话：

screen -r debug

我已将上述内容封装在一个方便的脚本中：

#!/bin/bash
if [ $# -lt 2 ]
then
  echo "Parallel Debugger Syntax: $0 <NP> <PROGRAM> [arg1] [arg2] [...]"
  exit 1
fi

the_time=`date +%s` #Use this so we can run multiple debugging sessions at once
                    #(assumes we are only starting one per second)

#The first argument is the number of processes. Everything else is what we want
#to run. Make a new mpi screen for each process.
mpirun -np $1 screen -AdmS ${the_time}.mpi gdb "${@:2}"

#Create a new screen for debugging from
screen -AdmS ${the_time}.debug

#The following are used for loading the debuggers into the debugging screen
firstpart="screen -S ${the_time}.debug"
secondpart=' -X screen -t tab$0 screen -r $1'

screen -list |                         #Get list of mpi screens
   grep -E "[0-9]+.${the_time}.mpi"  | #Extract the relevant ones
   awk '{print NR-1,$1}' |             #Generate tab #s and session ids, drop rest of the string
   xargs -n 2 sh -c "$firstpart$secondpart"

screen -r ${the_time}.debug            #Enter debugging screen

使用gdb在多个屏幕窗口中调试MPI

2 个答案: