如何从rpy2访问复杂的R数据结构字段

Question

我正在做rna-seq表达式分析我正在使用R包bioconductor，limma edgeR。我有一个由featureCounts函数返回的DGElist。如何使用rpy2访问python中此DGElist的字段？

我做了A["X"]但是当我{{1}}时，我无法看到R中显示的字段。谢谢！

Answer 1

大多数Bioconductor对象都使用R的S4系统。

您可以依赖相关R包中定义的访问者功能，也可以直接访问插槽。

有关于rpy2：http://rpy2.readthedocs.org/en/version_2.7.x/generated_rst/s4class.html

的S4的文档

否则，此处的具体问题是您在R全局环境中定义X。您需要查看rpy2的介绍。