Question

我有一个脚本，它根据ID列表查看不同的webtext URL。我想在每个文本页面（\ sC :)之后的字符串中提取特定信息。到目前为止，我能够将这些字符串输出存储在列表中，但是跟踪搜索到的原始ID与结果输出之间的对应关系并不是最好的。我想创建一个字典而不是列表，其中ID作为键被搜索，相应的输出作为值。

到目前为止，这是我的脚本：

import urllib2
import sys
import re

IDlist = ['C9JVZ1', 'C9JLN0', 'C9J872']

URLlist = ["http://www.uniprot.org/uniprot/"+x+".txt" for x in IDlist]
function_list = []
for item in URLlist:
    textfile = urllib2.urlopen(item)
    myfile = textfile.readlines();
    for line in myfile:
        print "line:", line;
        found = re.search('\s[C]:(.+?);', line);
        if found:
            function = found.group(1);
            function_list.append(function)

我得到的输出是：

['cytosol', 'nucleus', 'transcription factor complex']

http://www.uniprot.org/uniprot/C9JVZ1.txt

中找不到任何内容在http://www.uniprot.org/uniprot/C9JLN0.txt

中找到

Cytosol 在http://www.uniprot.org/uniprot/C9J872.txt

中找到了

和nucleus，transcription factor complex

我正在寻找的输出类似于：

{'C9JVZ1':[], 'C9JLN0':['cytosol'], 'C9J872':['nucleus', 'transcription factor complex']}

我试过了：

if found:
            function = found.group(1);
            function_dic = {item:[function]}

但我得到了这个输出：

>>> function_dic
{'http://www.uniprot.org/uniprot/C9J872.txt': ['transcription factor complex']}

Answer 1

function_dic = {item:[function]}

这会在每个循环中用最后一个条目覆盖字典，以修复你要执行的操作：

function_dic[item] = [function]

但这只是每次都会覆盖这个值，所以你只有一个函数，所以为了解决这个问题，你会这样做：

function_dic[item].append(function)

但是你需要在内部for循环之外初始化它：

function_dic[item] = []

您提到您希望ID不是URL，因此您可以更改外部for循环以包含ID并使用它来构建字典，因此将它们放在一起：

function_list = {}
for id, item in zip(IDlist, URLlist):
    function_list[id] = []
    ...
    for line in myfile:
        ...
        if found:
            function = found.group(1)
            function_list[id].append(function)

Python：使用来自不同输入的键和值创建一个词典

1 个答案: