如何使用Shiny和DT检索DataTables行信息?

时间:2015-09-16 11:44:05

标签: r datatables shiny dt

我使用Shiny和DT包来显示MySQL数据库中的过滤表。

简而言之,我从用户那里获得一个输入值,创建一个SQL查询,捕获输出并将其显示为DataTable。可以使用DataTable列过滤器进一步过滤输出,用户应该能够下载过滤后的数据集。

根据DT docsinput$table_rows_all应包含所显示表格的行索引。 但是,当我按下下载按钮时,我得到一个只有列名而没有数据的文件。

library(shiny)
library(DT)
library(RMySQL)

con <- dbConnect(MySQL(), user="myuser", host="myhost", dbname="mydb")

shinyServer(function(input, output) { 

                sqlOutput <- reactive({
                    sqlInput <- paste0("select * from mydb.mytable",
                           " where value < ", input$value,
                           ";")
                    dbGetQuery(con, sqlInput)
                })

                output$table <- DT::renderDataTable(sqlOutput(), server=TRUE, rownames=FALSE, filter="top", options=list(pageLength=10))

                output$download <- downloadHandler("filtered.data.txt", content = function(file) {
                                           rows <- input$table_rows_all
                                           write.table(sqlOutput()[rows, ], file, sep="\t", quote=FALSE, col.names=TRUE, row.names=FALSE)
                })

})

在上面的代码中,我将DBI::dbQuery()的输出保存到反应函数sqlOutput()中,以便我可以将其传递给DT::renderDataTable()shiny::downloadHandler()

我做错了什么?我不确定,但看起来input$table_rows_all由于某种原因返回空向量。

非常感谢任何帮助,谢谢!

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

您的示例不是真正可重现的,但如果您只是希望能够使用DT从闪亮的下载生成的表格,我会查看DT extensions。在那里,您可以看到您可以使用tableTools来选择下载,而不是使用手册downloadHandler

以下是展示功能的可重现示例:

注意 - 您需要在浏览器中安装www目录和flash

library(shiny)
library(DT)

data(iris)

runApp(list(
  ui = fluidPage(
    sidebarLayout(
      sidebarPanel("DT Download Example"),
      mainPanel(
        DT::dataTableOutput("mytable")
        )
      )
    ),
  server = function(input, output) {
    output$mytable <- DT::renderDataTable({
      iris
    }, 
    extensions = 'TableTools',
    rownames=FALSE, 
    filter="top", 
    options=list(dom = 'T<"clear">lfrtip',
                 tableTools = list(
                   sSwfPath = copySWF('www'),
                   aButtons = list('copy', 'print',
                                   list(
                                     sExtends = 'collection',
                                     sButtonText = 'Save',
                                     aButtons = c('csv','xls')
                                     )
                                   )
                   )
                 )
    )
  }))

以下是代码中相关部分的未经测试版本:

output$table <- DT::renderDataTable({
  sqlOutput()
}, server=TRUE, 
extensions = 'TableTools',
rownames=FALSE, 
filter="top", 
options=list(pageLength=10,
             dom = 'T<"clear">lfrtip',
             tableTools = list(
               sSwfPath = copySWF('www'),
               aButtons = list('copy', 'print',
                               list(
                                 sExtends = 'collection',
                                 sButtonText = 'Save',
                                 aButtons = c('csv','xls'))))))