如何使Shiny反应性与SQL数据库一起工作?

时间:2015-09-16 09:33:37

标签: sql r shiny reactive-programming rmysql

好吧,我在@Pork Chop建议之后修改了脚本:

server.R

library(shiny)
library(DT)
library(RMySQL)

con <- dbConnect(MySQL(), user="myuser", host="myhost", dbname="mydb")

shinyServer(function(input, output) { 

                sqlOutput <- reactive({
                    sqlInput <- paste0("select * from mydb.mytable",
                           " where value < ", input$value,
                           ";")
                    dbGetQuery(con, sqlInput)
                })

                output$table <- DT::renderDataTable(sqlOutput(), server=TRUE, rownames=FALSE, filter="top", options=list(pageLength=10))

                output$download <- downloadHandler("filtered.data.txt", content = function(file) {
                                           rows <- input$table_rows_all
                                           write.table(sqlOutput()[rows, ], file, sep="\t", quote=FALSE, col.names=TRUE, row.names=FALSE)
                })

})

DataTable现在可以使用了!

然而,当我尝试下载显示的数据时,我得到的文件只包含列名而没有数据。根据{{​​3}},输入$ table_rows_all应该包含显示表的行索引。

出了什么问题?

我在Shiny反应性和MySQL数据库方面遇到了麻烦。

简而言之,我从用户那里获得一个输入值,创建一个SQL查询,捕获输出并将其显示为DataTable。

可以使用DataTable列过滤器进一步过滤输出,用户应该能够下载过滤后的数据集。

server.R

library(shiny)
library(DT)
library(RMySQL)

con <- dbConnect(MySQL(), user="myuser", host="myhost", dbname="mydb")

shinyServer(function(input, output) {


                sqlInput <- reactive({
                    paste0("select * from mydb.mytable",
                           " where value < ", input$value,
                           ";")
                })

                sqlOutput <- reactive({
                    dbGetQuery(con, sqlInput)
                })

                output$table <- DT::renderDataTable(sqlOutput, server=TRUE, rownames=FALSE, filter="top", options=list(pageLength=10))

                output$download <- downloadHandler("filtered.data.txt", content = function(file) {
                                           rows <- input$table_rows_all
                                           write.table(sqlOutput[rows, ], file)
                })

})

而不是DataTable,我收到此错误:

DT docs

如果我将sqlInputsqlOutput嵌入DT::renderDataTable()中的被动表达式中,这可以正常工作,但我无法从sqlOutput引用downloadHandler()object 'sqlOutput' not foundreactive())内。我认为这是使用$x = new DateTime("2015-9-16 07:00:00"); $y = new DateTime("2015-9-16 20:00:00"); $diff = $x->diff($y); 的完美用例,但我无法使用它。

最好的方法是什么? 非常感谢任何帮助,谢谢!

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

1。 sqlOutput是一个函数,因此将其更改为sqlOutput()

2。试试这个,请注意这将导出为.csv希望确定

output$download <- downloadHandler(filename = function() {paste(Sys.time(), ' Fltered_data.csv', sep='')}, content = function(file) {write.csv(sqlOutput()[input$table_rows_all, ], file, row.names = FALSE)})