如何在R中绘制剂量反应模型?

时间:2015-09-14 13:14:49

标签: r model soil

我对R游戏比较陌生,因此试图将我的数据分析转换为R。

在excel中,我已经拟合了一个动力学模型来解释作为锰可用性函数的产量变化。

我想在R中绘制模型,并结合我的实验数据。

我已经尝试使用样本X值绘制模型Y值,并且因为它们没有排序,所以线条没有正确绘制。

有人可以帮忙吗?

也许有一种简单的方法可以将具有已定义参数的模型拟合到实验数据中?

1 个答案:

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如果您正在寻找经典的S形剂量 - 反应曲线,请尝试生态毒理学R包。它是Probit和Trimmed Spearman-Karber分析的EPA生态暴露研究部门(EERD)工具(1999年停产)的实施。

另一种选择是莫尔斯:生态毒理学中的繁殖和生存数据建模工具。

  

"致力于生态毒理学家和监管机构的工具   生物测定数据的数学和统计建模。他们使用   先进和创新的方法,有价值的定量   环境风险评估。"

这包括一些金属实例和生存数据。 drc也可以是一种选择(如上所述)。这是一个免费出版物,展示了drc的使用和扩展,"Dose-Response Analysis Using R"