Question

无法从R连接到sqlite .sqlite3安装在linxu服务器上，并且能够创建/修改。但是R没有连接。

library(dplyr)
library(RSQLite)

> db <- src_sqlite("my_db.sqlite3", create = TRUE)
Error in .local(drv, ...) : Could not connect to database:
unable to open database file

能够从命令行连接到sqlite

@ubuntu:~$ sqlite3
SQLite version 3.8.2 2013-12-06 14:53:30
Enter ".help" for instructions
Enter SQL statements terminated with a ";"
sqlite>

这是sessionInfo

sessionInfo（） R版本3.2.2（2015-08-14）平台：x86_64-pc-linux-gnu（64位）运行于：Ubuntu 14.04.1 LTS

locale:
 [1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8       LC_NUMERIC=C              
 [3] LC_TIME=en_US.UTF-8        LC_COLLATE=en_US.UTF-8    
 [5] LC_MONETARY=en_US.UTF-8    LC_MESSAGES=en_US.UTF-8   
 [7] LC_PAPER=en_US.UTF-8       LC_NAME=C                 
 [9] LC_ADDRESS=C               LC_TELEPHONE=C            
[11] LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C       

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

other attached packages:
[1] RSQLite_1.0.0 DBI_0.3.1     dplyr_0.4.3  

loaded via a namespace (and not attached):
[1] magrittr_1.5   R6_2.1.1       assertthat_0.1 parallel_3.2.2 tools_3.2.2   
[6] Rcpp_0.12.1   
>

Answer 1

SQLite是一个文件级数据库，因此引用它需要一个完整的目录路径。否您在何处指定工作目录或文件名中的完整路径。

默认情况下，R将使用getwd()中包含的当前工作目录。如果此文件夹中未包含数据库，则会出现连接错误。您可以使用setwd()更改工作目录。

顺便说一句，您引用了这两个包，但使用src_sqlite使用dplyr包连接到SQLite，而不是使用RSQLite。

RSQLite连接

library(RSQLite)

setwd("/Path/To/Database/Folder")
sqlite <- dbDriver("SQLite")
conn <- dbConnect(sqlite,"my_db.sqlite3")

DPLYR连接

library(dplyr)

setwd("/Path/To/Database/Folder")
db <- src_sqlite("my_db.sqlite3", create = TRUE)

您可能不希望同时调用这两个库以避免相同命名函数的冲突。

R连接到sqlite

1 个答案: