我需要从rserve
启动并继续运行R
。
我的rserve.r
文件中有这些行:
library(Rserve)
Rserve()
所以,我正在尝试在我的upstart脚本中执行类似的操作:
description "Rserve service"
author "Valter Silva"
start on filesystem or runlevel [2345]
stop on shutdown
respawn
script
echo $$ > /var/run/rserve.pid
exec /usr/bin/R /home/valter/R/rserve.R >> /home/valter/test2.log
end script
pre-start script
echo "[`date`] Rserve Starting" >> /var/log/rserve.log
end script
pre-stop script
rm /var/run/rserve.pid
echo "[`date`] Rserve Stopping" >> /var/log/rserve.log
end script
我知道该服务因我文件test2.log
的输出而运行。但它只运行一次。我该怎么办才能让它继续运行?
答案 0 :(得分:1)
你(和我)遇到这么多麻烦的原因是我们提出错误的问题。正确的问题是“我们如何从客户端代码启动Rserve?”Java(以及大多数其他)客户端具有StartRserve的功能。
这个问题的答案在这里是针对java库的:How to start Rserve automatically from Java?
或者这里是C#库: https://github.com/SurajGupta/RserveCLI2/blob/master/RServeCLI2.Test/Rservice.cs
另一种方法是学习the best。摇杆项目复制supervisor.conf
到/etc/supervisor/conf.d/
(见https://github.com/rocker-org/rocker/blob/master/rstudio/Dockerfile#L61)
您的supervisor.conf
可以添加类似
[program:Rserve]
command=/usr/bin/Rserve.sh
stdout_logfile=/var/log/supervisor/%(program_name)s.log
stderr_logfile=/var/log/supervisor/%(program_name)s.log
user=myuser
startsecs=0
autorestart=false
exitcodes=0
但......
我确实搞清楚了。所以这就是答案。我很抱歉它有点笨拙和分布。对我来说,我最大的障碍是将我的开始/停止脚本放在/usr/bin
文件夹中(参见下面的讨论)
/etc/init/Rserve.conf
description "Rserve service"
author "Victor I. Wood"
version "0.01"
# based on
# https://stackoverflow.com/questions/32485131/how-to-make-an-upstart-service-to-rserve
env STARTSCRIPT=/usr/bin/Rserve.sh
env STOPSCRIPT=/usr/bin/Rserve.stop
env LOGFILE=/var/log/Rserve.log
start on runlevel [2345]
stop on runlevel [!2345]
console output
respawn
# tell upstart we're creating a daemon
# upstart manages PID creation for you.
expect fork
pre-start script
echo "[`date`] Rserve Starting" >> $LOGFILE
echo $$ > /var/run/Rserve.pid
end script
pre-stop script
rm /var/run/Rserve.pid
echo "[`date`] Rserve Stopping" >> $LOGFILE
exec $STOPSCRIPT >> $LOGFILE
end script
script
# My startup script, plain old shell scripting here.
exec $STARTSCRIPT >> $LOGFILE
# echo $$ > /var/run/rserve.pid
end script
/usr/bin/Rserve.sh
#!/bin/sh
sudo --login --set-home --user=myuser bash -c '~/Rserve.sh >~/Rserve.log 2>&1'
/usr/bin/Rserve.stop
#!/bin/sh
pkill -U myuser Rserve
/home/myuser/Rserve.sh
#!/bin/sh
# launch new Rserve process
R CMD Rserve --RS-conf /home/myuser/Rserve.conf --no-save >~/Rserve.log 2>&1
https://askubuntu.com/questions/62812/why-isnt-my-upstart-service-starting-on-system-boot?lq=1
我开始使用脚本
https://askubuntu.com/questions/62729/how-do-i-set-up-a-service?lq=1
并注意到initctl
启动可能会对调试有用。
https://askubuntu.com/questions/62812/why-isnt-my-upstart-service-starting-on-system-boot?lq=1
请注意,该脚本必须位于/bin
(但我使用/usr/bin
),并且必须由root
拥有。有些人喜欢在脚本i /bin
如同How to make an upstart service to Rserve?的人 我建议,我正在使用我在rServe文档中找到的Rserve start命令
R CMD Rserve
虽然我已将我的扩展到
R CMD Rserve --RS-conf /home/myuser/Rserve.conf --no-save >~/Rserve.log 2>&1
我没有输出正确的pid,所以我用pkill来阻止它。
是一种更优雅的方法RSshutdown(rsc)
How can I shut down Rserve gracefully?
stdout& stderr混淆了暴发户,所以用2>&1
重新导出所有输出
How to redirect both stdout and stderr to a file
我发现时有点想通了 https://www.digitalocean.com/community/tutorials/the-upstart-event-system-what-it-is-and-how-to-use-it 和 https://geeknme.wordpress.com/2009/10/15/getting-started-with-upstart-in-ubuntu/ http://blog.joshsoftware.com/2012/02/14/upstart-scripts-in-ubuntu/ 但是对于那些只是想要开始的人来说,那些比官方文档更实用的起点。
此解决方案假设Upstart,这是原始问题,但Upstart不再是默认服务管理器。如果您想在16.04之后的系统上执行此操作,请使用
更改回Upstartsudo apt-get install upstart-sysv
sudo update-initramfs -u
sudo apt-get purge systemd
(来自http://notesofaprogrammer.blogspot.com/2016/09/running-upstart-on-ubuntu-1604-lts.html)
答案 1 :(得分:0)
正如Rserve的公共文档所述,您可以从shell脚本启动Rserve守护程序。
只需创建一个执行以下命令的脚本:
echo 'library(Rserve);Rserve(FALSE,args="--no-save --slave --RS-conf <your_own_path>/rserve.conf")'|<R_bin_path>/R --no-save --slave
例如,在我的MacOS计算机中,我可以启动Rserve执行此行:
/bin/sh -c "echo 'library(Rserve);Rserve(FALSE,args=\"--slave\")'|/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.2/Resources/bin/exec/R --no-save --slave"
此命令输出如下内容:
Starting Rserve:
/Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R CMD /Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.2/Resources/library/Rserve/libs//Rserve --slave
Rserv started in daemon mode.
确保指定&#34; - 奴隶&#34;启动Rserve时的参数。
您可以创建一个shell脚本(或Windows脚本),并告诉操作系统在启动过程中执行此脚本。