绘制树时间轴（进化历史）

Question

我目前正在撰写一篇文献综述，我希望能够通过绘制我读过的论文以及他们通过引用作为横向树的联系来绘制一些算法的演变，并使x轴与出版日期相对应。

这是我正在寻找的一个例子。

问题

• 这种类型的图表是什么？
• 是否有现有工具或示例来生成此类图表？

理想情况下，我想在R中使用D3.js，但我很灵活。

注意：来自Cross Validated

的交叉发布

Answer 1

您所追求的可视化类型称为“分支图”，用于分支学，或基于共享特征的生物分类。应用进一步分类的其他类似可视化被称为＆＃39; phylograms＆＃39;或者＆＃39;系统发育树。＆＃39;

快速谷歌后，我找到了this R package，ggtree，这似乎可以做你想要的（如果你需要，分支树和标记的x轴甚至y轴的潜力）。此包装似乎也允许高度可定制的图表。祝你好运！