如何修改MPI阻止发送和接收到非阻塞

时间:2015-09-06 23:52:07

标签: c parallel-processing mpi openmpi message-passing

我试图了解使用MPI进行并行处理时阻塞和非阻塞消息传递机制之间的区别。假设我们有以下阻止代码:

#include <stdio.h> 
#include <string.h> 
#include "mpi.h"

int main (int argc, char* argv[]) {
    const int maximum_message_length = 100;
    const int rank_0= 0;
    char message[maximum_message_length+1]; 
    MPI_Status status; /* Info about receive status */ 
    int my_rank; /* This process ID */
    int num_procs; /* Number of processes in run */ 
    int source; /* Process ID to receive from */
    int destination; /* Process ID to send to */
    int tag = 0; /* Message ID */

    MPI_Init(&argc, &argv);
    MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &my_rank); 
    MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &num_procs);

    /* clients processes */
    if (my_rank != server_rank) {
        sprintf(message, "Hello world from process# %d", my_rank);
        MPI_Send(message, strlen(message) + 1, MPI_CHAR, rank_0, tag, MPI_COMM_WORLD);
    } else {    
    /* rank 0 process */ 
        for (source = 0; source < num_procs; source++) { 
            if (source != rank_0) {
                MPI_Recv(message, maximum_message_length + 1, MPI_CHAR, source, tag, 
                MPI_COMM_WORLD,&status);
                fprintf(stderr, "%s\n", message); 
            } 
        } 
    } 
         MPI_Finalize();
}

每个处理器执行其任务并将其发送回rank_0(接收方)。 rank_0将运行从1到n-1个进程的循环并按顺序打印它们(如果当前客户端尚未发送其任务,则循环中的步骤可能不会继续)。如何使用MPI_IsendMPI_Irecv修改此代码以实现非阻止机制?我是否需要删除接收器部分(rank_0)中的循环并为每个客户端显式声明MPI_Irecv(..),即

MPI_Irecv(message, maximum_message_length + 1, MPI_CHAR, source, tag, 
                    MPI_COMM_WORLD,&status);

谢谢。

1 个答案:

答案 0 :(得分:4)

您使用非阻止通信执行的操作是发布通信,然后立即继续执行您的程序以执行其他操作,这可能会发布更多通信。特别是,您可以立即发布所有收据,并等待它们稍后完成。 这是您通常在此方案中执行的操作。

但请注意,此特定设置是一个不好的示例,因为它基本上只是重新实现MPI_Gather

以下是您在设置中进行非阻塞通信的方法。首先,您需要一些存储空间来存档所有消息,还需要一个请求句柄列表来跟踪非阻塞通信请求,因此您需要相应地更改代码的第一部分:

#include <stdlib.h>
#include <stdio.h>
#include <string.h>
#include "mpi.h"

int main (int argc, char* argv[]) {
    const int maximum_message_length = 100;
    const int server_rank = 0;
    char message[maximum_message_length+1];
    char *allmessages;
    MPI_Status *status; /* Info about receive status */
    MPI_Request *req; /* Non-Blocking Requests */
    int my_rank; /* This process ID */
    int num_procs; /* Number of processes in run */
    int source; /* Process ID to receive from */
    int tag = 0; /* Message ID */

    MPI_Init(&argc, &argv);
    MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &my_rank);
    MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &num_procs);

    /* clients processes */
    if (my_rank != server_rank) {
        sprintf(message, "Hello world from process# %d", my_rank);
        MPI_Send(message, maximum_message_length + 1, MPI_CHAR, server_rank,
                 tag, MPI_COMM_WORLD);
    } else {

这里不需要非阻塞发送。现在我们继续在server_rank上接收所有这些消息。我们需要遍历所有这些并存储每个请求句柄:

    /* rank 0 process */
        allmessages = malloc((maximum_message_length+1)*num_procs);
        status = malloc(sizeof(MPI_Status)*num_procs);
        req = malloc(sizeof(MPI_Request)*num_procs);

        for (source = 0; source < num_procs; source++) {
            req[source] = MPI_REQUEST_NULL;
            if (source != server_rank) {
                /* Post non-blocking receive for source */
                MPI_Irecv(allmessages+(source*(maximum_message_length+1)),
                          maximum_message_length + 1, MPI_CHAR, source, tag,
                          MPI_COMM_WORLD, req+source);
                /* Proceed without waiting on the receive */
                /* (posting further receives */
            }
        }
        /* Wait on all communications to complete */
        MPI_Waitall(num_procs, req, status);
        /* Print the messages in order to the screen */
        for (source = 0; source < num_procs; source++) {
            if (source != server_rank) {
                fprintf(stderr, "%s\n",
                        allmessages+(source*(maximum_message_length+1)));
            }
        }
    }
    MPI_Finalize();
}

在发布非阻塞接收后,我们需要等待所有这些接收完成,以正确的顺序打印消息。为此,使用了MPI_Waitall,这允许我们阻塞,直到满足所有请求句柄。请注意,为简单起见,我在此处包含server_rank,但最初将其请求设置为MPI_REQUEST_NULL,因此将被忽略。 如果您不关心订单,您可以通过循环处理请求并使用MPI_Waitany来尽快处理通信。只要任何通信完成,您就可以返回,并且您可以对相应的数据采取行动。

使用MPI_Gather,代码如下所示:

#include <stdlib.h>
#include <stdio.h>
#include <string.h>
#include "mpi.h"

int main (int argc, char* argv[]) {
    const int maximum_message_length = 100;
    const int server_rank = 0;
    char message[maximum_message_length+1];
    char *allmessages;
    int my_rank; /* This process ID */
    int num_procs; /* Number of processes in run */
    int source; /* Process ID to receive from */
    int tag = 0; /* Message ID */

    MPI_Init(&argc, &argv);
    MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &my_rank);
    MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &num_procs);

    if (my_rank == server_rank) {
        allmessages = malloc((maximum_message_length+1)*num_procs);
    }
    sprintf(message, "Hello world from process# %d", my_rank);
    MPI_Gather(message, (maximum_message_length+1), MPI_CHAR,
               allmessages, (maximum_message_length+1), MPI_CHAR,
               server_rank, MPI_COMM_WORLD);

    if (my_rank == server_rank) {
        /* Print the messages in order to the screen */
        for (source = 0; source < num_procs; source++) {
            if (source != server_rank) {
                fprintf(stderr, "%s\n",
                        allmessages+(source*(maximum_message_length+1)));
            }
        }
    }
    MPI_Finalize();
}

使用MPI-3,您甚至可以使用非阻塞MPI_Igather

如果您不关心订购,最后一部分(从MPI_Waitall开始)可以通过MPI_Waitany完成,如下所示:

    for (i = 0; i < num_procs-1; i++) {
        /* Wait on any next communication to complete */
        MPI_Waitany(num_procs, req, &source, status);
        fprintf(stderr, "%s\n",
                allmessages+(source*(maximum_message_length+1)));
    }