Question

我在MacOS上运行RStudio，需要使用一些自定义命令行工具，例如csvcut（csvkit的一部分），以便我们团队中的多个人在他们的计算机上使用该功能。

如果我在终端中运行system('pip install csvcut)（我正在使用此命令作为示例;通常，我将运行csvcut）来自R，它可以工作（检查上一版本是否已经安装等），就像我从命令行终端那样做。

如果我在RStudio中做同样的事情：

> system('pip install csvkit')
sh: pip: command not found

如果我在终端中执行which pip并将地址复制粘贴到RStudio中，则可以正常工作：

system('/anaconda3/anaconda/bin/pip install csvkit')
Requirement already satisfied (use --upgrade to upgrade): csvkit in /anaconda3/anaconda/lib/python3.4/site-packages
# etc.

^如果我只是从终端中的R做system('pipinstall csvkit')，那就是输出。

不幸的是，我甚至无法从RStudio中运行which pip。（另外，我不能自动pip install csvkit用于其他人的机器，因为它需要sudo访问。）如果有办法将RStudio指向R的路径，那就更容易了。

我在某个网站上发现了说明创建.Renviron文件且其中有R_LIBS_USER=~/R/library行的说明，但这没有帮助。

Answer 1

尝试将此行添加到.Renviron文件中：

PATH=/anaconda3/anaconda/bin:$PATH

将PATH添加到RStudio的路径

1 个答案: