Question

我是R编程的新手。我创建了一个简单的R脚本并尝试使用JAVA类运行它，但我无法做到。

我尝试过使用Rserve和rJava。使用Rserve，代码执行在创建＆＃34; RConnection＆＃34;的实例后停止。而使用rJava给出异常＆＃34; java.lang.UnsatisfiedLinkError：jri.dll：无法找到依赖库＆＃34;。

JAVA类代码如下：

对于rJava：

    import org.rosuda.JRI.Rengine;
public class Temp {

public static void main(String a[]) {
    // Create an R vector in the form of a string.
    String javaVector = "c(1,2,3,4,5)";

    // Start Rengine.
    Rengine engine = new Rengine(new String[] { "--no-save" }, false, null);

    // The vector that was created in JAVA context is stored in 'rVector' which is a variable in R context.
    engine.eval("rVector=" + javaVector);

    //Calculate MEAN of vector using R syntax.
    engine.eval("meanVal=mean(rVector)");

    //Retrieve MEAN value
    double mean = engine.eval("meanVal").asDouble();

    //Print output values
    System.out.println("Mean of given vector is=" + mean);

}
}

对于Rserve：

import org.rosuda.REngine.REXPMismatchException;
import org.rosuda.REngine.Rserve.RConnection;
import org.rosuda.REngine.Rserve.RserveException;
public class Temp {

public static void main(String a[]) {
    RConnection connection = null;
    System.out.println("line 10");
    try {
        // Create a connection to Rserve instance running on default port 6311

        System.out.println("line 15");
        connection = new RConnection();
        System.out.println("line 17");
        //Note four slashes (\\\\) in the path
        connection.eval("source('D:\\\\RExamples\\\\helloworld.R')");
        System.out.println("line 19");
        int num1=10;
        int num2=20;
        int sum=connection.eval("myAdd("+num1+","+num2+")").asInteger();
        System.out.println("The sum is=" + sum);
    } catch (RserveException e) {
        e.printStackTrace();
    } catch (REXPMismatchException e) {
        e.printStackTrace();
    }
}
}

如果您的问题不清楚或者您想知道其他任何问题，请告诉我。提前谢谢。

Answer 1

连接Java和R有两种不同的方法。

如果要使用 JRI ，则必须使用指向包含JRI库的文件夹的JVM参数-Djava.library.path启动java程序。

例如：

$JAVA_HOME/bin/java  -Djava.library.path=/app/vendor/R/lib/R/library/rJava/jri/ -jar target/myapp.jar

如果您在查找JRI安装目录时遇到问题，请尝试查找JRI SO库：

find / -name "libjri.*"

此外，请确保在您的环境中创建了R_HOME和LD_LIBRARY_PATH：

R_HOME ：指向您当地的R安装（Ej：/Library/Frameworks/R.framework/Resources）
LD_LIBRARY_PATH ：指向R lib目录以及JRI目录（EJ：$ LD_LIBRARY_PATH：/ app / vendor / R / lib / R / lib：/ app / vendor / R / lib / R / bin）中

另一方面，如果您想使用 Rserve ，则需要在单独进程中启动Rserve，然后从Java进程创建RConnection。 / p>

例如：

        if(LOGGER.isInfoEnabled()) {
            LOGGER.info("Starting RServe process...");
        }
        ProcessBuilder builder = new ProcessBuilder("/bin/sh", "-c", String.format("echo 'library(Rserve);Rserve(FALSE,args=\"--no-save --slave --RS-conf %s\")'|%s --no-save --slave", rserveConf, rexe));
        builder.inheritIO();
        Process rProcess = builder.start();

        if(LOGGER.isInfoEnabled()) {
            LOGGER.info("Waiting for Rserve to start...");
        }
        int execCodeResult = rProcess.waitFor();

        if(execCodeResult != SUCCESS_CODE) {
            LOGGER.error(String.format("Unexpected error code starting RServe: %d", execCodeResult));
        } else {
            LOGGER.error("RServe started successfully");
        }

        if(LOGGER.isInfoEnabled()) {
            LOGGER.info("Opening connection to RServe daemon....");
        }
        REngine engine = new RConnection();
        if(LOGGER.isInfoEnabled()) {
            LOGGER.info(String.format("Obtaining R server version: %d", ((RConnection)engine).getServerVersion()));
        }
        //Perform some engine.parseAndEval("....");

rserveConf 是Rserv配置文件的路径， rexe 是R可执行文件的完整路径。

例如，在我的MacOS计算机中，我可以启动Rserve执行此行：

/bin/sh -c "echo 'library(Rserve);Rserve(FALSE,args=\"--slave --RS-conf /Users/me/Documents/test/rserve.conf\")'|/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.2/Resources/bin/exec/R --no-save --slave"

此命令输出如下内容：

Starting Rserve:
  /Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R CMD /Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.2/Resources/library/Rserve/libs//Rserve --slave 

Rserv started in daemon mode.

确保指定＆＃34; - 奴隶＆＃34;启动Rserve时的参数。

如果你想看到更多的例子，我有一个演示项目，在我的github中使用JRI和RServe两种方法：

https://github.com/jfcorugedo/RJavaServer

Answer 2

您只想调用外部应用程序：不会进行以下工作吗？

Runtime.getRuntime().exec("Rscript myScript.R");

信用转到stackoverflow itself

Answer 3

另一种方法是使用r的OpenCpu软件包。这是一个非常简单的服务器（不幸的是单线程），通过http接收r函数调用并返回输出作为响应。

我用它来与java接口。

使用JAVA程序运行R脚本

3 个答案: