Question

我是Shiny的新手，我正在尝试使用excel文件中的数据来运行应用程序。似乎它应该很简单，但无法弄明白。在更复杂的任务（交互式上传文件，指定列，文件位置等）上有大量信息 - 但我想要的只是一个应用程序，它使用来自后台加载的单个excel文件中的数据。

之前已经提出过类似的问题（Uploading csv file to shinyApps.io和R Shiny read csv file），但我没有得到他们的满意答案。

我将excel文件保存在与app.R文件相同的目录中，位于名为“data”的文件夹中。我将其读入我脚本的server部分，如下所示：

server <- function(input, output){
  # Read in data
  myDF <- read_excel('data/MyShinyData.xlsx')

当我运行app.R文件来测试应用程序时，它运行正常。但是当我使用shinyapps::deployApp('pathToWorkingDirectory')将其发布到Shiny网站时，我得到了一个没有交互性的应用程序的灰色版本。如果我模拟app.R文件中的数据（excel文件只是这个模拟数据，用write.xlsx写入excel），该应用程序也会向网站发布罚款 - 仅当我拿出用于模拟数据的代码时并将其替换为它停止工作的read_excel命令。我也尝试使用.csv文件而不是.xlsx，但同样的问题。

我已经从下面的app.R文件中复制了完整的代码。

我做错了什么？谢谢你的帮助。

library('ggplot2')
library('shiny')
library('psych')
library('readxl')

#===============
#This code makes a histogram, a coplot, and a prediction for species richness ('SpNat') given Forest cover ('NBT').
#===============

m1 <- lm(SpNat ~ NBT, data=myDF) #For prediction. best to create all non-reactive [ie non-updating] code outside the app, so it doesn't have to run every time.

#==========
# ui section
#==========

ui <- fluidPage(

  ### MAKING A TITLE
  titlePanel("Dashboard based on excel data"),

  ### DIVIDING INPUTS TO SIDEBAR VS MAIN PANELS:
  sidebarLayout(

    sidebarPanel(                                                           #everything nested in here will go in sidebar
  #dropdown input for coplot:
  tags$h3('Select coplot variables'), #heading
  selectInput(inputId='choiceX', label='Choose X variable', 
              choices=c('Species richness'='SpNat', 'Forest cover'='NBT', 'Pest control'='PC')), #***Choices are concatenated text strings. 
  selectInput(inputId='choiceY', label='Choose Y variable', 
              choices=c('Species richness'='SpNat', 'Forest cover'='NBT', 'Pest control'='PC')),
  selectInput(inputId='choiceZ', label='Choose conditioning variable', 
              choices=c('Species richness'='SpNat', 'Forest cover'='NBT', 'Pest control'='PC')),
#checkbox input for pairs plots:
  tags$h3('Select variables for pairs plots'), #heading
  checkboxGroupInput(inputId='vars', label='Choose at least two variables for pairs plot', 
                   selected=c('SpNat', 'NBT', 'PC'), #'determines which vars start off checked. Important for pairs, cos <2 and plot wont work.
                   choices=c('Species richness'='SpNat', 'Forest cover'='NBT', 'Pest control'='PC')), #***Server receives input as a single concatenated text 

#slider input for prediction:  
  tags$h3('Predicting forest cover'), #heading
  sliderInput(inputId='num',label='Pick a forest cover level', value=10, min=1, max=100)),

  mainPanel(                                                               #everything nested in here will go in main panel
#specify output for app, including headings:
  tags$h3('Coplot:'),
  plotOutput(outputId='coplot'),
  tags$h3('Histogram:'),  
  plotOutput(outputId='pairs'),
  tags$h3('Predicted species richness:'),  
  verbatimTextOutput('prediction'))))

#==========
# server section
#==========

server <- function(input, output){
  # Read in data
  myDF <- read_excel('data/MyShinyData.xlsx') #don't need full path
  myDF$PC <-  as.factor(myDF$PC)
  myDF <- select(myDF, SpNat, NBT, PC)

  #create output object, and name it so it corresponds to the ui output function ID, plus use the ui input ID to create it: 
  output$coplot <- renderPlot(
    ggplot(myDF, aes_string(input$choiceX, input$choiceY, col=input$choiceZ)) + geom_point())    #note use of aes_string to allow inputID use direct.
  output$pairs <- renderPlot({
    pairs.panels(subset(myDF, select=input$vars))})
  output$prediction <- renderPrint({
    newData <- data.frame(NBT=input$num)
    cat(predict(m1, newdata = newData))
  })
}

#==========
# and stitch together
#==========

shinyApp(ui=ui, server=server)

Answer 1

想出来。我有两个问题：

（1）我在发布之前已将应用程序复制到新文件夹中，因此工作目录已更改 - 需要在运行shinyapps::deployApp之前重置为包含app.R文件的文件夹。

（2）我的应用程序需要的几个软件包自动加载到我的R控制台（我已经对我的.Rprofile文件进行了更改）。因此，虽然我不需要加载这些应用程序来在本地运行应用程序，但我确实在网上发布了它。

两个相当愚蠢的错误，但你生活和学习。

将excel文件读入Shiny

1 个答案: