有一个tomcat应用程序在我们的一台服务器上运行（由我们实验室中的其他人编写而已经不在了）。我对tomcat及其工作方式知之甚少，但我已将问题缩小到两个解决方案。
我在网页上收到的错误是：
java.io.IOException：无法运行程序＆＃34; hmmtop＆＃34;：error = 2，没有这样的文件或目录
服务器信息 Tomcat版本JVM版本JVM供应商OS名称OS版本OS体系结构 Apache Tomcat / 6.0.26 1.6.0_65-b14-462-10M4609 Apple Inc. Mac OS X 10.6.8 x86_64
在os x更新之前，这个脚本运行正常。现在找不到名为＆＃39; hmmtop＆＃39;的程序。这个节目，＆＃39; hmmtop＆＃39;位于：/ Users / saierlab / bin / hmmtop，当然确实存在。
解决方案1） 我尝试更改名为＆＃39; myfile.java＆＃39;的文件。使用绝对路径，现在看起来像这样：
String command = "/Users/RAVEN/bin/hmmtop -if=" + this.fileName + ".fa";
此文件位于＆＃34; / usr / local / tomcat / webapps / avehas / WEB-INF / classes＆＃34; 但是，当我改变它时，没有任何反映。我不确定如何编译这些更改。我试过运行javarc myfile.java，它只给了我数百个错误，所以我不会想到我是怎么回事。请注意，我之前从未使用过Tomcat。
我没有原始的WAR文件或其他任何内容，该目录中的内容是我与此特定程序有关的全部内容。
解决方案2） 如果我无法弄清楚如何重新编译这个脚本，有没有办法让Tomcat知道我的$ PATH变量中的/ Users / RAVEN / bin /目录？
谢谢！