用于在多个文件上运行tabix命令的shell脚本

时间:2015-08-28 15:35:15

标签: shell

我的目录中存储了22个文件。所有文件都是aldy bgzipped和have.gz.我想使用tabix索引每个文件并将所有文件转换为.tbi。我对一个脚本感兴趣,该脚本遍历我的所有文件并执行此过程,但不会将所有文件合并在一起。我在linux命令行上运行此分析。

感谢您的帮助

1 个答案:

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这应该可以胜任:for f in ./*.vcf.gz; do tabix -p vcf -f $f;done