Ipython / Jupyter - 我们可以编程“运行上面的所有单元格”吗?

时间:2015-08-28 09:18:28

标签: python jupyter

我正在使用带有python的jupyter 4,当发生崩溃时,我需要我的脚本执行“重新启动上面的所有单元格”。 有可能吗?

第二个问题:如果我需要重新启动所有的单元格,我可以让python根据一些cell-id执行它们吗?然后,我可以创建一个单元格id列表,在捕获异常时必须重新执行...

THX。

3 个答案:

答案 0 :(得分:4)

我正在运行Notebook服务器5.4.0并且我有一个选项Cell > Run All Above,它似乎就是这样做的。

enter image description here

答案 1 :(得分:2)


第二个问题:否


...至少不是很可靠,因为如果您插入或删除任何其他单元格,则该单元格的任何ID都会更改。

根据github上的Execute specific cells through widgets and conditions

  

我们没有单元格的ID来处理它们   以编程方式。

然后继续讨论同一帖子:

  

有些API可以运行由数字标识的单元格,但是   不幸的是,如果您插入或删除一个单元格,数字就会改变   上方某处。


第一个问题:是


...但是并不能100%地确定它将根据您的问题的详细信息满足您的错误处理需求。但是,我们将稍作讨论。因为好消息是标题中问题的答案

  

Ipython / Jupyter-我们可以编写一个“在上方运行所有单元格”吗?

我们可以!

这个问题的难点(甚至是不可能的)是将其实现为可靠的错误处理方法。如果您只对此感兴趣,请跳到我答案结尾的 The hard part 部分。现在,让我们继续 easy part ,以编程方式运行菜单选项Cell > Run All(如Nic Cottrell的回答所述)。您有两种选择:

选项1-通过执行单元格来运行以上所有单元格:

如果在单元格中插入以下代码段并运行它,则将执行以上所有单元格:

from IPython.display import Javascript
display(Javascript('IPython.notebook.execute_cells_above()'))

选项2-通过单击按钮运行上方的所有单元格:

如果在单元格中插入以下代码段并运行它,则单击出现的按钮时,将执行上方的所有单元格:

代码段:

from IPython.core.display import display, HTML
HTML('''<script> </script> <form action="javascript:IPython.notebook.execute_cells_above()"><input type="submit" id="toggleButton" value="Run all"></form>''')

输出:

enter image description here


THE HARD PART

那么,当发生崩溃时,我们如何设置它来处理错误?我不是这方面的专家,但我认为我已经能够做出适合您的设置。但这很可能取决于所讨论的错误类型以及您的其余工作流程。

以下示例基于两个不同的错误消息。第一个是NameError,当您尝试将值分配给不存在的变量时发生。这将很有用,因为在错误后重新运行某些单元将需要一个迭代器,该迭代器仅在笔记本完全重新启动时才重置,而在作为错误处理方法的一部分重新运行单元时则不需要。仅在重新启动笔记本计算机后重新启动内核时,才会发生名称错误。作为错误处理的一部分,将值0分配给x1。仅在重新运行单元格时,x1将增加1

第二个错误将充当 您的 错误的代理,并且是每次您尝试delete an element from a list that does not exist时都会发生的AssignmentError。这导致我们面临真正的挑战,因为如果您的错误处理程序在每次触发错误时都重新运行上方的所有单元,那么您很快就会陷入一个糟糕的循环。但是,我们将使用一个计数器来处理该问题,该计数器会在运行几次后退出单元的循环执行。

似乎还不存在重新运行您的 现有单元格 或运行run cells above功能的单元格的功能,这也有点问题初始化。但是我们将通过与之前相同的github帖子中的另一个建议来处理该问题:

  

执行以下操作有助于我在代码下面执行单元格   细胞。您还可以更改值以获取单元格其他部分中的单元格   笔记本。   display(Javascript('IPython.notebook.execute_cell_range(IPython.notebook.get_selected_index()+1, IPython.notebook.get_selected_index()+2)'))

具有建议工作流程的笔记本

在四个单元格中插入以下四个片段。单击菜单选项Cell > Run all,我们一切顺利!

代码段1-导入和设置

import sys
import os
from IPython.core.display import display, HTML
from IPython.display import Javascript
from random import randint

# Trigger to randomly raise en error in the next cell
ErrorTrigger = randint(0, 9)

# Assignment of variables at first run of the Norebook
try: x1
except NameError: x1 = None
if x1 is None:
    %qtconsole # opens a qtconsole (for variable inspection and debugging)
    x1 = 0 # counter for NameError
    x2 = 0 # counter for assignment error (used in cells below)
    mr = 0 # counter for manual relaunch by button 

    ErrorTriggers=[] # container for ErroTriggers    
    print('NameErrors = ', x1)
else:
    x1 = x1 + 1
    ErrorTriggers.append(ErrorTrigger)
#print('Executions:', x1, '||', 'Triggers:', ErrorTriggers)

代码段2-代理您的错误

# PROXY ERROR => INSERT YOUR CODE FROM HERE ################################################################
list1 = [1,2,3,4]

# 80 % chance of raising an error trying to delete an element that does not exist in the list
if ErrorTrigger > 2:
    elemDelete = 8 # error
else:
    elemDelete = 0 # not error
try:
    del list1[elemDelete]
    print('Executions:', x1, '||', 'Triggers:', ErrorTriggers)
    print('Routine success on attempt', x2 + 1)
    print('Error mesg: None')
    ErrorTriggers=[]
    x2 = 0 # reset error counter

# TO HERE #################################################################################################
except Exception:

    x2 = x2 + 1
    # Will end error handler after 5 attempts
    if x2 < 3:
        # As long as we're UNDER the attempt limit, the next cell executed by:
        display(Javascript('IPython.notebook.execute_cell_range(IPython.notebook.get_selected_index()+1,'+
                           ' IPython.notebook.get_selected_index()+2)'))
    else:
        # If we're OVER the attempt limit, it all ends here. The next cell is NOT run.
        # And NEITHER is the last cell with the button to relaunch the whole thing.

        print('Executions:', x1, '||', 'Triggers:', ErrorTriggers)
        print('Routine aborted after attempt', x2)
        print('Error msg:', sys.exc_info()[1]) # Returns a message describing the error
        # reset variables 
        ErrorTriggers = []
        x2 = 0

代码段3-单元重新运行上面的所有单元作为错误处理程序

display(Javascript('IPython.notebook.execute_cells_above()'))

代码段4-以20%的错误概率重新运行整个程序

HTML('''<script> </script> <form action="javascript:IPython.notebook.execute_cells_above()"><input type="submit" id="toggleButton" value="Run again!"></form>''')

几次测试运行后的屏幕截图:

enter image description here

如果代码段中的注释不清楚,我会很乐意添加更多详细信息。 但是,如果您通过单击Run Again!几次运行笔记本,同时查看单元格3的输出,则可以快速掌握整个内容的组合方式:

enter image description here

答案 2 :(得分:1)

这是给jupyterlab

  1. 转到:Settings->Advanced Settings Editor->Keyboard Shortcuts

  2. User Preferences窗口中粘贴以下代码:

{
    "shortcuts": [
        {
            "command": "notebook:run-all-above",
            "keys": [
        "Shift Backspace"
      ],
      "selector": ".jp-Notebook.jp-mod-editMode"
        }
    ]
}
  1. 单击“保存”(在user-preferences窗口的右上方)

这将立即生效。在这里,连续两次按下shift + backspace将运行所选行上方的所有单元格。 显然,system defaults的所有菜单命令(包括此代码(搜索run-all-above)都有空模板。