Anaconda Python：如何安装缺少的依赖？

Question

我正在尝试从此处安装graph-tool：http://anaconda.org/vgauthier/graph-tool，使用该页面上提到的命令。

我使用了给定的命令行：

conda install -c http://conda.anaconda.org/vgauthier graph-tool

我收到以下错误：

  

错误：无法找到图形工具的某些依赖项：pixman

所以我尝试以类似的方式安装pixman：http://anaconda.org/rwest/pixman。

conda install -c http://conda.anaconda.org/rwest pixman

这成功了。

在尝试安装graph-tool时，仍然存在“无法找到依赖”错误。为什么会发生这种情况，我该如何解决？我没有其他错误消息可以继续。

Answer 1

Conda需要能够立即找到所有依赖项。 -c标志仅为该一个命令添加该通道。您需要运行conda install -c vgauthier rwest graph-tool。但更简单的方法是将这些渠道添加到您的配置

conda config --add channels vgauthier --add channels rwest

一旦你这样做，你就可以运行

conda install graph-tool 

它会抓住这些渠道的东西。

Answer 2

Anacona 2020.11 的冲突依赖

在 2021 年 4 月使用 Anaconda（版本 2020.11）设置 fedora-33 virtual machine 时，我遇到了相互冲突的依赖关系，因为 graph-tool 与 python version 3.8.5 不兼容。指出 here，要走的路是使用具有受支持的 Python 版本的虚拟环境（在我的情况下为 3.7.9，因为我仍然是 Anaconda 版本 2020.03 的新手）。

就我而言，将 Anaconda NOT 安装为 sudo 很重要。 否则，某些 conda-alias 设置不正确（which conda 应该给出一个带有一些 if/else 条件的大约 30 行命令）。

这里是 bash 命令：

$ cd ~/Downloads/
$ wget https://repo.anaconda.com/archive/Anaconda3-2020.11-Linux-x86_64.sh
$ sudo chown -R user:user /opt/  # needed in my case to avoid sudo for installing Anaconda and calling conda later
$ bash Anaconda3-2020.11-Linux-x86_64.sh  # location: /opt/anaconda3, run conda init: yes
$ source ~/.bashrc  # make command conda available. Like restarting terminal in this case.
$ conda create -n envGraphTool anaconda python=3.7.9
$ conda activate envGraphTool
$ conda install -c conda-forge graph-tool

测试一切是否正常：

(envGraphTool) [user@f33 Downloads]$ which python
/opt/anaconda3/envs/envGraphTool/bin/python
(envGraphTool) [user@f33 Downloads]$ python -V
Python 3.7.9
(envGraphTool) [user@f33 Downloads]$ python
Python 3.7.9 (default, Aug 31 2020, 12:42:55) 
[GCC 7.3.0] :: Anaconda, Inc. on linux
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>> import graph_tool as gt
>>> exit()
(envGraphTool) [user@f33 Downloads]$