使用mgcv gam模型进行条件Logisitc回归分析

时间:2015-08-25 21:12:37

标签: r plot gam cox-regression mgcv

我正在使用带有family = cox.ph()的mgcv包运行GAM模型,并按层(strata = id)对我的数据进行分组。该数据对应于单个动物的一个使用位置和与该个体相关的20个随机位置可供使用。

require(mgcv)
require(survival)
require(smoothHR)

gam1 = gam(time1~s(DWL)+strata(id),family=cox.ph(),method = "REML",data=dataset, weight = event1)

模型运行平稳,但我不确定如何将关系绘制为x变量。 DWL是一个连续变量。我使用以下内容来预测图表:

x = seq(0,120) #extent of DWL values
plot(gam1,residuals=T,trans=function(x)exp(x)/(1+exp(x)),shade=T)

我对在剧情语法中使用trans参数感到有点困惑。使用cox.ph()进行家庭评估,logit-link是评估您对x变量DWL的预测y响应的正确方法吗?

谢谢,

P Farrell

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