Question

我想要做的是搜索第一列不以“＆＃39; rs”开头的行。或者＆＃39; chr＆＃39;那么如果这些行以数字开头，则添加＆＃39; chr＆＃39;到第一列值的开头，否则保持原样。

我有以下代码：

awk '((!($1 ~ /rs/ || $1 ~ /chr/)) && $1 ~ /^[[:0-9:]]|$/) {$1 = "chr"$1}1' filename > newfilename

这很好，但附上了＆＃39; chr＆＃39;对于不以＆＃39; rs＆＃39;开头的所有第一列值或者＆＃39; chr＆＃39;此列中有一些我不想更改的值，这些值都以字母（a-z）开头。我只想更改以数字（0-9）开头的值。

谢谢！

Answer 1

我很确定[[:0-9:]]没有按照您的意愿行事。有关括号表达式的详细信息，您可以man re_format。您可能想要的是[[:digit:]]。但99.9％的时间[0-9]就足够了。

怎么样......

awk '/^(rs|chr)/{print; next} /^[0-9]/{$1="chr" $1} 1' oldfile > newfile

为便于阅读而分手，这就是我们正在做的事情：

# If the line starts with a marker, print it and move to the next line.
/^(rs|chr)/ {
  print;
  next;
}

# If the line starts with a number, convert it.
/^[0-9]/ {
  $1="chr" $1;
}

# If we're still processing, print the line.
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请注意，当您更改字段内容时，awk会折叠空格。

当然，如果你真的想要＆＃34; PREPEND＆＃34;而不是＆＃34;追加＆＃34;，然后脚本更简单，因为我们可以假设任何以数字开头的行不包含＆＃34; rs＆＃34;或者＆＃34; chr＆＃34;一开始。

awk '/^[0-9]/ { printf("chr") } 1' oldfile > newfile

另外，你没有说你是否想要现有的＆＃34; chr＆＃34;和＆＃34; rs＆＃34;要打印或忽略的行。上述解决方案打印出来。要忽略它们，只需使用：

awk '/^(rs|chr)/{ next } /^[0-9]/ { printf("chr") } 1' oldfile > newfile

使用Awk编辑数字列值

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