R中栅格图层之间的成对相关

Question

我需要在从WordClim数据库中提取的非洲大陆的19个栅格图层之间完成成对的Pearson相关。我想检查哪些变量层与我的模型更相关/重要。为此，我尝试使用Raster包中的layerStats函数，但在执行后我的输出不包含数值，所有行和列都显示了NAs值。 以下是我的剧本。

#Loading raster files from WorldClim database
rastFiles<- list.files(pattern="bil")
a<-stack(rastFiles)

# Adjusting for African Continent
newext<-c(-20, 55, -35, 45)
Africa<-crop(a,newext)
Africa

#Correlation
cor<-layerStats(Africa,'pearson')

Answer 1

在r中，只需使用下面的代码，确保你有na.rm = T来处理跨层的NA：

library(raster)    
jnk=layerStats(raster_stack, 'pearson', na.rm=T)
corr_matrix=jnk$'pearson correlation coefficient'