R调色板不打印指定的颜色

时间:2015-08-18 09:40:22

标签: r plot colors

我想在绘图上绘制一些线条,并根据分数绘制每个线段,我希望将颜色绘制为蓝色( - 值) - 白色(0值) - 红色(+值)的渐变。 现在使用我的代码的Segments部分,我可以这样做,如果我给出一个特定的颜色,如col="red" or col="blue",它的效果很好。因此,由于数据的庞大规模,我希望使用以下内容自动化它:

rbPal <- colorRampPalette(c('red','white','blue'))
jcolor<-rbPal(nrow(datasetsize))

问题在于,当我绘制数据时,它只是绘制随机颜色,而不是我使用调色板指定的颜色,即使检查html颜色代码它是正确的颜色。任何帮助将不胜感激。 (见下面的代码)

测试数据:

Sample  loc Start   End p   sm
S1  9   1000000 10000000    2   -7.5751
S2  9   11000000    18000000    6   -1.5906
S3  9   20000000    40000000    3   0
S4  9   50000000    70000000    2   0.8
S5  9   80000000    100000000   2   1.25
S6  9   110000000   140000000   6   7.789

代码:

### Read in Data
data<-read.table("stack_eg.txt",header=TRUE,sep="\t")

### Order Setdata Object
data<-data[order(data$sm,decreasing=T),]

### Setup Plot Space
plot(1, type="n", axes=T, xlab="X", ylab="Y",ylim=c(1,6),xlim=c(0,142000000))

### Color setup
rbPal <- colorRampPalette(c('red','white','blue'))
jcolor<-rbPal(6)
jonzo<-cbind(data,jcolor)

### Plot data
for(l in 1:nrow(jonzo)){
  startpos<-jonzo$Start[l]
  endpos<-jonzo$End[l]
  segments(startpos,2,endpos,2,col=jonzo$jcolor[l])
}

我得到的图像是这样的: enter image description here

而不是像这样的图像: enter image description here

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

好的,看起来问题出在以下部分:

grep -r --include="*.php" '$_SESSION['"'"'id'"'"']' /var/www/ > grep.txt

这将从列绑定文件中读取颜色代码#FF0000。 如果您只是从jcolor对象中读取颜色代码,那么它可以工作并生成以下图像: enter image description here

以下是感兴趣的人的调整后代码:

jonzo<-cbind(data,jcolor)