在我目前的作品中，我使用php脚本接受查询，然后将查询传递给perl脚本：
<?php
`perl function.pl parameters`
?>
在perl脚本中，外部软件用于预处理和生成输出文件：
$#perl/bin/perl
system "software -out outputfile";
问题是软件成功生成了输出文件，但文件意外空白。这个问题只发生在我从网站加载查询时，perl脚本运行良好，这意味着输出文件包含单词，当我直接通过服务器的终端运行perl脚本时。
我甚至将www-data添加到我自己的用户组中，并修改了输出文件的权限：
open A, ">> outputfile";
close A;
chmod 0775, outputfile;
system "software -out outputfile";
但是，输出文件仍然是空白的。我还可以进一步尝试解决这个问题？