Rscript是否更改了LD_LIBRARY_PATH？

Question

我正在运行R版本（未使用intel parallel studio编译）并且正在尝试加载我自己编译的英特尔编译的共享Fortran库。在我用来运行的脚本中，我包含LD_LIBRARY_PATH，然后使用Rscript运行R脚本（调用dyn.load("My_Fortran.so")，使用ifort和mkl编译）。

但是，当我运行脚本时，它会因Intel MKL FATAL ERROR: Cannot load libmkl_avx.so or libmkl_def.so而失败。 Rscript是否有可能取消LD_LIBRARY_PATH的设置？如果没有，是不是因为这个版本的R没有用intel parallel studio编译，它是否有可能无法加载共享库？

以下是我运行R脚本并加载路径的方法：

#!/bin/bash
module load R/3.1.0
LD_LIBRARY_PATH=/path/to/intel_parallel_studio/xe_2015_u3/install/mkl/lib/intel64:$LD_LIBRARY_PATH
export LD_LIBRARY_PATH
Rscript myRscript.r

R脚本失败并显示：

Running R code
Attempting to load Fortran compiled shared library ... Done!
Calling Fortran subroutine from within R ... 
MKL FATAL ERROR: Cannot load libmkl_avx.so or libmkl_def.so

Answer 1

您可以查看R和Rscript的shell脚本源代码。

通常，此类PATH设置（对于可执行文件以及共享库）通常仅添加到而不会被覆盖。所以你可能有另一个问题。

可以修改/etc/ld.so.conf吗？

修改还要考虑在之前设置LD_LIBRARY_PATH module load R/3.1.0。