Question

我正在尝试在jupyter笔记本中使用R.

我去了我的R shell跑了

install.packages(c('rzmq','repr','IRkernel','IRdisplay'),
             repos = c('http://irkernel.github.io/', getOption('repos')))
IRkernel::installspec()

然后我加载了我的ipython笔记本，并使用现有的R扩展程序创建了一个新笔记本。然而，当我访问笔记本时，我遇到了这个内核错误：

Traceback (most recent call last):
  File "C:\Users\Nina Kate\Anaconda3\lib\site-packages\IPython\html\base\handlers.py", line 394, in wrapper
    result = yield gen.maybe_future(method(self, *args, **kwargs))
  File "C:\Users\Nina Kate\Anaconda3\lib\site-packages\IPython\html\services\sessions\handlers.py", line 53, in     post
    model = sm.create_session(path=path, kernel_name=kernel_name)
  File "C:\Users\Nina Kate\Anaconda3\lib\site-packages\IPython\html\services\sessions\sessionmanager.py", line 66, in create_session
    kernel_name=kernel_name)
  File "C:\Users\Nina Kate\Anaconda3\lib\site-packages\IPython\html\services\kernels\kernelmanager.py", line 84, in start_kernel
    kernel_name=kernel_name, **kwargs)
  File "C:\Users\Nina Kate\Anaconda3\lib\site-packages\IPython\kernel\multikernelmanager.py", line 112, in start_kernel
km.start_kernel(**kwargs)
  File "C:\Users\Nina Kate\Anaconda3\lib\site-packages\IPython\kernel\manager.py", line 240, in start_kernel
**kw)
  File "C:\Users\Nina Kate\Anaconda3\lib\site-packages\IPython\kernel\manager.py", line 189, in _launch_kernel
return launch_kernel(kernel_cmd, **kw)
  File "C:\Users\Nina Kate\Anaconda3\lib\site-packages\IPython\kernel\launcher.py", line 202, in launch_kernel
proc = Popen(cmd, **kwargs)
  File "C:\Users\Nina Kate\Anaconda3\lib\subprocess.py", line 859, in __init__
restore_signals, start_new_session)
  File "C:\Users\Nina Kate\Anaconda3\lib\subprocess.py", line 1112, in _execute_child
startupinfo)
    FileNotFoundError: [WinError 2] The system cannot find the file specified

Answer 1

我在Windows 7中遇到了完全相同的错误。我将R添加到PATH环境变量中，并且我能够在shell上运行它，但我仍然在Jupyter中遇到内核错误。

内核使用：

开始工作when installed system wide

IRkernel::installspec(user = FALSE)

而不是第一个安装选项：

IRkernel::installspec()

请注意，必须设置两个参数，即PATH变量和R系统范围的安装。

Answer 2

您可能错过了关于irkernel repo中缺少索引的警告：

Warning: unable to access index for repository http://irkernel.github.io/src/contrib:
   cannot download all files

new installation步骤适用于我（在R 3.3控制台中）：

install.packages('devtools')
devtools::install_github('IRkernel/IRkernel') # IRkernel-master.tar.gz
IRkernel::installspec()  # register kernel in the current R install
IRkernel::installspec(name = 'ir33', displayname = 'R 3.3')  # ir32, R 3.2

重新启动jupyter notebook时，“R 3.3”条目应出现在内核列表中。

Answer 3

如果使用Windows 10而不是Anaconda，请尝试此操作；

使用记事本查看您现有的内核文件。文件位于：

〜AppData \ Roaming \ Jupyter \ kernels

此文件将显示安装Jupyter时使用的R版本。如果更改或升级了当前使用的R版本，则R Kernel将无法在Jupyter中使用。

R Studio->工具->全局选项->更改，以查看PC上安装的R的版本。如果R的当前版本与内核文件中的版本不同，请选择该R的其他版本。关闭R Studio并重新打开以验证使用的版本。关闭R Studio并打开Jupyter Notebook，然后选择R内核。 R内核现在应该可以工作了。

使用Jupyter Notebook的R笔记本中的内核错误

3 个答案: