如何解决内存不足的问题？

Question

我有一个矩阵A，其大小为2000 * 50000 double。我想计算一下 矩阵A的协方差矩阵，所以我使用这个Matlab命令：

Y = cov(A)

但是出现了错误：

Out of memory. Type HELP MEMORY for your
options.
Error in test_2 (line 31)
Y = cov(A)

我的D盘仍有250 GB。为什么会出现这个错误？ 如何解决这个问题？

Answer 1

您需要至少0.8（GB）才能将A存储在内存中。如果您查看cov.m，您会看到matlab正在计算协方差矩阵（我在下面使用您的变量名称）

Y = (A' * A) / size(A,1);

由于A为2k x 50k，A' * A将为50k x 50k，这需要20（GB）的内存。我猜你的机器没有那么多可用。您仍然可以计算协方差矩阵，但是您必须编写自己的函数来以块/块的形式计算它，并将结果存储到文件中而不是保留它。