R:双向Anova与ez包不匹配

时间:2015-08-03 18:53:22

标签: r statistics anova

我使用的是ez软件包,但我意识到结果有时与anova函数不匹配。我想知道自己做错了什么。

options(contrasts=c("contr.sum","contr.poly")) 
datafilename="https://docs.google.com/spreadsheets/d/1PNHSBMUdPnB_mnP_WrcxYYiwCwN8KHL2Q57KoAoWdAY/pub?gid=0&single=true&output=csv"
data.ex2=read.csv(datafilename,header=1,stringsAsFactors=FALSE) 
data.ex2                                     
aov.ex2 = aov(value~Treat*Gender,data=data.ex2  )         
summary(aov.ex2)  

### testing the ez package now 

library(ez) 

A = ezANOVA(
  data = data.ex2
  , dv = value
  , wid = ID
  , between = .(Treat,Gender)
  ,return_aov=TRUE
  , type = 3
)

print (A$ANOVA)
  • 当我使用另一个网站上给出的示例时,结果完全匹配,所以我想知道我的桌子是否有错误。此处匹配来自此数据集的示例。

    datafilename =" HTTP://personality-project.org/r/datasets/R.appendix2.data"

谢谢!

2 个答案:

答案 0 :(得分:2)

每个分组都有多个ID的观察结果。运行代码时在警告中提到了这一点,并且它表示值已折叠到它们的平均值。所以,在幕后它会做以下事情,

library(plyr)
collapsed <- ddply(data.ex2, .(ID, Treat, Gender), function(x)
    mean(x[, "value"]))

## the mean value is now in column `V1`
aov(V1 ~ Treat*Gender, data=collapsed)

答案 1 :(得分:0)

好的,我终于明白了。需要最后一个命令。

drop1(aov.ex2, .~., test="F")

现在它有效,作为参考,我从这里得到了这个信息:

http://goanna.cs.rmit.edu.au/~fscholer/anova.php