Question

我正在尝试将行附加到从文件读取的空列表中，并且我已经删除了返回行和换行符，但是应该将一行作为两个单独的项输入到列表中。< / p>

DNA = open('DNAGCex.txt')
DNAID = []
DNASEQ = []
for line in DNA:
    line = line.rstrip()
    line = line.lstrip()
    if line.startswith('>')==True:
        DNAID.append(line)
    if line.startswith('>')==False:
        DNASEQ.append(line)
print DNAID
print DNASEQ

这是输出

['＆gt; Rosalind_6404'，'＆gt; Rosalind_5959'，'＆gt; Rosalind_0808'] ['CCTGCGGAAGATCGGCACTAGA'，'TCCCACTAATAATTCTGAGG'，'CCATCGGTAGCGCATCCTTAGTCCA'，'ATATCCATTTGTCAGCAGACACGC'，'CCACCCTCGTGGTATGGCTAGGCATTCAG'，'TGGGAACCTGCGGGCAGTAGGTGGAAT']

我希望它看起来像这样：

['＆gt; Rosalind_6404'，'＆gt; Rosalind_5959'，'＆gt; Rosalind_0808'] ['CCTGCGGAAGATCGGCACTAGATCCCACTAATAATTCTGAGG'，'CCATCGGTAGCGCATCCTTAGTCCAATATCCATTTGTCAGCAGACACGC'，'CCACCCTCGTGGTATGGCTAGGCATTCAGTGGGAACCTGCGGGCAGTAGGTGGAAT']

这是源材料，只需删除's：

[ '＆GT; Rosalind_6404' CCTGCGGAAGATCGGCACTAGA TCCCACTAATAATTCTGAGG '＆GT; Rosalind_5959' CCATCGGTAGCGCATCCTTAGTCCA ATATCCATTTGTCAGCAGACACGC '＆GT; Rosalind_0808' CCACCCTCGTGGTATGGCTAGGCATTCAG TGGGAACCTGCGGGCAGTAGGTGGAAT]

Answer 1

在循环的每次迭代中，您只需查看文件中的某一行。这意味着，虽然你肯定会在最后附加不包含换行符的行，但你仍然一次附加一个文件行。您必须让解释器知道您想要组合某些行，通过在首次开始读取DNASEQ时设置标志并在下一个DNAID开始时清除它。

for line in DNA:
    line = line.strip() # gets both sides
    if line.startswith('>'):
        starting = True
        DNAID.append(line)
    elif starting:
        starting = False
        DNASEQ.append(line)
    else:
        DNASEQ[-1] += line

Answer 2

您可以将.lstrip()和.rstrip()合并为一个.strip()来电。

然后，您认为.append()在列表中添加了行并将行连接成一行。在这里，我们使用空字符串启动DNASEQ并使用+=将这些行连接成一个长字符串：

DNA = open('DNAGCex.txt')
DNAID = []
DNASEQ = []
for line in DNA:
    line = line.strip()
    if line.startswith('>'):
        DNAID.append(line)
        DNASEQ.append('')
    else:
        DNASEQ[-1] += line
print DNAID
print DNASEQ

Python：追加行

2 个答案: