R中的fread错误 - 在字符串中嵌入nul：'\ 0'

Question

我正在尝试读取csv文件＆gt; 4GB，但是，当我使用fread命令时，它会产生错误

library(data.table)
csv1 <- fread("cleaned.csv",sep = ",",colClasses = "character",showProgress = TRUE)

错误： embedded nul in string: '\0'

经过一番观察，我发现你可以使用sed功能 例如在这个stackoverflow Question但我不知道如何在我的场景中使用它。请帮忙！

更新 我试图在注释中使用sed函数，但是，它们会引发错误。

sed couldn't flush stdout no space left on device

UPDATE2： 我已经在一些同事的帮助下解决了这个问题。但是，我仍然希望自动执行此活动，因为我必须为每个文件重复此过程。预期的自动化将来自R内或使用BASH脚本。有什么建议吗？

Answer 1

csv文件填充了^ @并且它们被放置在空白值内，不知何故它们无法通过sed命令进行搜索或替换以解决问题，我遵循以下解决方案。 在linux中，按照文件目录并使用vim命令，如， vim filename.csv ：％S / CTRL + 2 //克 ESC #TO从INSERT MODE切换 ：wq＃保存文件 我必须手动为每个文件执行此操作。但是，我仍然在寻找一种在R中或使用BASH脚本自动执行此操作的方法。