Scikit F-score指标错误

时间:2015-07-28 13:05:32

标签: python machine-learning scikit-learn logistic-regression cross-validation

我正在尝试使用Logistic Regression from SciKit.预测一组标签我的数据确实是不平衡的(还有很多' 0'而不是' 1'标签)所以我有在交叉验证步骤中使用F1 score metric来平衡"结果。

[Input]
X_training, y_training, X_test, y_test = generate_datasets(df_X, df_y, 0.6)
logistic = LogisticRegressionCV(
    Cs=50,
    cv=4,
    penalty='l2', 
    fit_intercept=True,
    scoring='f1'
)
logistic.fit(X_training, y_training)
print('Predicted: %s' % str(logistic.predict(X_test)))
print('F1-score: %f'% f1_score(y_test, logistic.predict(X_test)))
print('Accuracy score: %f'% logistic.score(X_test, y_test))

[Output]
>> Predicted: [0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0]
>> Actual:    [0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 1]
>> F1-score: 0.285714
>> Accuracy score: 0.782609
>> C:\Anaconda3\lib\site-packages\sklearn\metrics\classification.py:958:  
   UndefinedMetricWarning:
   F-score is ill-defined and being set to 0.0 due to no predicted samples.

我当然知道这个问题与我的数据集有关:它太小了(它只是真实数据集的一个样本)。但是,任何人都可以解释" UndefinedMetricWarning"警告,我看到了?窗帘后面究竟发生了什么?

2 个答案:

答案 0 :(得分:4)

它似乎是一个已知的错误here已修复,我想你应该尝试更新sklearn。

答案 1 :(得分:1)

  

但是,有人可以解释我所看到的“UndefinedMetricWarning”警告的含义吗?窗帘后面究竟发生了什么?

https://stackoverflow.com/a/34758800/1587329

详细描述了这一点
  

https://github.com/scikit-learn/scikit-learn/blob/master/sklearn/metrics/classification.py

     
    

F1 = 2 *(精确*召回)/(精确+召回)

  
     

precision = TP /(TP + FP)正如你刚才所说,如果预测器没有   完全预测正类 - 精度为0。

     

召回= TP /(TP + FN),如果预测变量不能预测为正数   class - TP为0 - 召回为0。

     

所以现在你要划分0/0。

要解决加权问题(分类器很容易(几乎)总是预测更普遍的类),您可以使用class_weight="balanced"

logistic = LogisticRegressionCV(
    Cs=50,
    cv=4,
    penalty='l2', 
    fit_intercept=True,
    scoring='f1',
    class_weight="balanced"
)

LogisticRegressionCV说:

  

“平衡”模式使用y的值自动调整输入数据中与类频率成反比的权重n_samples / (n_classes * np.bincount(y))