我有2个列表(list1
,list2
),其中包含各种位置的纬度/经度。一个列表(list2
)具有list1
没有的位置名称。
我想要list1中每个点的近似位置。所以我想在list1
中找一点,尝试在list2
中查找最近的点,然后选择该地点。我重复了list1
中的每一点。它还需要距离(以米为单位)和点的索引(在list1
中),因此我可以围绕它构建一些业务规则 - 基本上这些是应添加到list1
的2个新cols( near_dist
,indx
)。
我正在使用gdist
函数,但我无法使用数据框输入。
示例输入列表:
list1 <- data.frame(longitude = c(80.15998, 72.89125, 77.65032, 77.60599,
72.88120, 76.65460, 72.88232, 77.49186,
72.82228, 72.88871),
latitude = c(12.90524, 19.08120, 12.97238, 12.90927,
19.08225, 12.81447, 19.08241, 13.00984,
18.99347, 19.07990))
list2 <- data.frame(longitude = c(72.89537, 77.65094, 73.95325, 72.96746,
77.65058, 77.66715, 77.64214, 77.58415,
77.76180, 76.65460),
latitude = c(19.07726, 13.03902, 18.50330, 19.16764,
12.90871, 13.01693, 13.00954, 12.92079,
13.02212, 12.81447),
locality = c("A", "A", "B", "B", "C", "C", "C", "D", "D", "E"))
答案 0 :(得分:51)
要使用纬度/经度坐标计算两个点之间的地理距离,您可以使用多个公式。包geosphere
包含distCosine
,distHaversine
,distVincentySphere
和distVincentyEllipsoid
,用于计算距离。其中,distVincentyEllipsoid
被认为是最准确的,但计算上比其他更强。
使用这些功能之一,您可以制作距离矩阵。根据该矩阵,您可以根据locality
的最短距离和which.min
的相应距离(请参阅答案的最后部分)分配min
名称,如下所示:
library(geosphere)
# create distance matrix
mat <- distm(list1[,c('longitude','latitude')], list2[,c('longitude','latitude')], fun=distVincentyEllipsoid)
# assign the name to the point in list1 based on shortest distance in the matrix
list1$locality <- list2$locality[max.col(-mat)]
这给出了:
> list1
longitude latitude locality
1 80.15998 12.90524 D
2 72.89125 19.08120 A
3 77.65032 12.97238 C
4 77.60599 12.90927 D
5 72.88120 19.08225 A
6 76.65460 12.81447 E
7 72.88232 19.08241 A
8 77.49186 13.00984 D
9 72.82228 18.99347 A
10 72.88871 19.07990 A
另一种可能性是根据locality
中locality
的平均经度和纬度值分配list2
:
library(dplyr)
list2a <- list2 %>% group_by(locality) %>% summarise_each(funs(mean)) %>% ungroup()
mat2 <- distm(list1[,c('longitude','latitude')], list2a[,c('longitude','latitude')], fun=distVincentyEllipsoid)
list1 <- list1 %>% mutate(locality2 = list2a$locality[max.col(-mat2)])
或data.table
:
library(data.table)
list2a <- setDT(list2)[,lapply(.SD, mean), by=locality]
mat2 <- distm(setDT(list1)[,.(longitude,latitude)], list2a[,.(longitude,latitude)], fun=distVincentyEllipsoid)
list1[, locality2 := list2a$locality[max.col(-mat2)] ]
这给出了:
> list1
longitude latitude locality locality2
1 80.15998 12.90524 D D
2 72.89125 19.08120 A B
3 77.65032 12.97238 C C
4 77.60599 12.90927 D C
5 72.88120 19.08225 A B
6 76.65460 12.81447 E E
7 72.88232 19.08241 A B
8 77.49186 13.00984 D C
9 72.82228 18.99347 A B
10 72.88871 19.07990 A B
正如您所看到的,这导致大多数(10个中的7个)场合导致另一个locality
。
您可以添加距离:
list1$near_dist <- apply(mat2, 1, min)
或max.col
的另一种方法(极有可能更快):
list1$near_dist <- mat2[matrix(c(1:10, max.col(-mat2)), ncol = 2)]
# or using dplyr
list1 <- list1 %>% mutate(near_dist = mat2[matrix(c(1:10, max.col(-mat2)), ncol = 2)])
# or using data.table (if not already a data.table, convert it with 'setDT(list1)' )
list1[, near_dist := mat2[matrix(c(1:10, max.col(-mat2)), ncol = 2)] ]
结果:
> list1
longitude latitude locality locality2 near_dist
1: 80.15998 12.90524 D D 269966.8970
2: 72.89125 19.08120 A B 65820.2047
3: 77.65032 12.97238 C C 739.1885
4: 77.60599 12.90927 D C 9209.8165
5: 72.88120 19.08225 A B 66832.7223
6: 76.65460 12.81447 E E 0.0000
7: 72.88232 19.08241 A B 66732.3127
8: 77.49186 13.00984 D C 17855.3083
9: 72.82228 18.99347 A B 69456.3382
10: 72.88871 19.07990 A B 66004.9900
答案 1 :(得分:0)
此解决方案致谢Martin Harringa,该解决方案在您需要通过遍历Mark Needham's blog上的数据帧来执行此功能时使此方法更容易
library(dplyr)
df %>%
rowwise() %>%
mutate(newcolumn_distance = distHaversine(c(df$long1, df$lat1),
c(df$long2, df$lat2)))
我分别使用了distm和distHaversine这两个函数对来自真实数据集的大样本进行了测试,并且distHaversine的发布速度似乎比distm函数快得多。我感到很惊讶,因为我认为两者只是两种格式的相同功能。
答案 2 :(得分:0)
我在下面添加了使用spatialrisk软件包的解决方案。此软件包中的关键功能是用C ++(Rcpp)编写的,因此非常快。
spatialrisk :: points_in_circle()函数计算从中心点开始的半径范围内的观测值。请注意,距离是使用Haversine公式计算的。由于输出的每个元素都是一个数据帧,因此使用purrr :: map_dfr将它们行绑定在一起:
ans <- purrr::map2_dfr(list1$longitude,
list1$latitude,
~spatialrisk::points_in_circle(list2, .x, .y,
lon = longitude,
lat = latitude,
radius = 2000000)[1,])
cbind(list1, ans)
longitude latitude longitude latitude locality distance_m
1 80.15998 12.90524 77.76180 13.02212 D 260484.0591
2 72.89125 19.08120 72.89537 19.07726 A 616.6369
3 77.65032 12.97238 77.64214 13.00954 C 4230.7216
4 77.60599 12.90927 77.58415 12.92079 D 2694.4566
5 72.88120 19.08225 72.89537 19.07726 A 1590.8723
6 76.65460 12.81447 76.65460 12.81447 E 0.0000
7 72.88232 19.08241 72.89537 19.07726 A 1487.8028
8 77.49186 13.00984 77.58415 12.92079 D 14089.1051
9 72.82228 18.99347 72.89537 19.07726 A 12089.6454
10 72.88871 19.07990 72.89537 19.07726 A 759.8012