计算代谢模型的成对距离

时间:2015-07-25 11:44:44

标签: bioinformatics euclidean-distance

我正致力于比较细菌代谢模型。每个模型由一组代谢物组成。

  

例如Model1 - {M1,M2,M3,M4}(M1-代谢物名称)
       Model2 - {M3,M4,M5,M6,M7,M8}

我必须比较这两个模型之间的差异,生成相异矩阵并最终聚类它们。我收到的关于计算相异度矩阵的一个建议是"计算每个代谢物的成对欧几里德距离并总结这些差异"。在这种情况下,我对如何比较欧几里德距离感到困惑,因为这些不是数字。

我正在寻找关于如何实现这一目标的理论解释。

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