我有一个在WinPython下运行并运行良好的Cython代码,但是当我从WinPython切换到Anaconda3时,我遇到了问题。我正在使用Python 3.4
测试代码是:
# cython: boundscheck=False
# cython: wraparound=False
# cython: cdivision=True
cimport cython
cimport numpy as np
import numpy as np
from numpy cimport ndarray as ar
from libc.math cimport *
cpdef ar[double, ndim=1, mode='c'] test(ar[double, ndim=1, mode='c'] x):
cdef:
int n = x.shape[0]
Py_ssize_t i
ar[double, ndim=1, mode='c'] y = np.zeros(n)*np.nan
with nogil:
for i in range(0, n):
y[i] = x[i]+1
return y
编译代码是:
from distutils.core import setup
from distutils.extension import Extension
from Cython.Distutils import build_ext
import numpy as np
ext_modules = [Extension('test', ['tech/test.pyx'], include_dirs=[np.get_include()],
define_macros=[('NPY_NO_DEPRECATED_API', None)],
extra_compile_args=['-O3', '-march=native', '-ffast-math'],
libraries=['m']
)]
setup(
name="Test Function",
cmdclass={'build_ext': build_ext},
ext_modules=ext_modules
)
我正在使用MinGw进行编译,所以在...\Anaconda3\Lib\distutils
文件夹下我有一个文件
[build]
compiler = mingw32
另外在PATH环境变量中,我有:
默认: ... \ Anaconda3 ... \ Anaconda3 \脚本
还补充说: ... \ Anaconda3 \ libs(包含python34)
还添加了:从WinPython复制的包含gcc
等的mingw32文件:
... \ Anaconda3 \ Tools \ tools \ mingw32 \ bin(这包含gcc)
... \ Anaconda3 \工具\工具\的mingw32 \ x86_64的-W64-的mingw32 \ BIN
当我尝试:
python setup.py build_ext --inplace
代码运行正常,直到生成test.c
,test.o
和test.def
为止。此后这就是我得到的:
C:\Anaconda3\Tools\tools\mingw32\bin\gcc.exe -shared -s build\temp.win-amd64-3.4\Release\tech\test.o build\temp.win-amd64-3.4\Release\tech\test.def -LC:\Anaconda3\libs -LC:\Anaconda3\PCbuild\amd64 -lm -lpython34 -lmsvcr100 -
o P:\ Documents \ Temp \ python-master \ python-master \ common \ test.pyd
build\temp.win-amd64-3.4\Release\tech\test.o:test.c:(.text+0x8e): undefined reference to `__imp_PyExc_TypeError'
build\temp.win-amd64-3.4\Release\tech\test.o:test.c:(.text+0x10e): undefined reference to `__imp_PyExc_ValueError'
build\temp.win-amd64-3.4\Release\tech\test.o:test.c:(.text+0x259): undefined reference to `__imp__PyThreadState_Current'
....
....
C:/Anaconda3/Tools/tools/mingw32/bin/../lib/gcc/x86_64-w64-mingw32/4.9.2/../../../../x86_64-w64-mingw3 ild\temp.win-amd64-3.4\Release\tech\test.o: bad reloc address 0x0 in section `.data'
collect2.exe: error: ld returned 1 exit status
error: command 'C:\\Anaconda3\\Tools\\tools\\mingw32\\bin\\gcc.exe' failed with exit status 1
首先,我无法在任何地方找到Anacond3\PCBuild\amd64
目录/文件。
我试图浏览互联网,但找不到__imp_PyExc_TypeError
,__imp__PyThreadState_Current
,__imp_PyExc_ValueError
的任何引用。
最终转换为*.pyd
文件可能出现什么问题?
答案 0 :(得分:1)
我怀疑Anaconda还不支持mingw-64。
历史上,mingw-64确实是一个毫无希望的想法,直到Cark Kleffner带来他的静态版本。
当Carl的更新版本可以作为mingwpy wheel使用时,事情可能(应该?)改变。
答案 1 :(得分:1)
你可以运行
conda remove libpython
使Anaconda使用Visual Studio而不是mingw,这可能会更好。