ETE2 - 具有多个父母的一个子节点？

Question

我尝试使用Python中的ETE2模块创建树。我想将1个子节点添加到2个父节点，以便在显示树时它们都连接到子节点。我是ETE的新手，所以如果这是一个简单的问题，请原谅我。 代码：

from ete2 import Tree, TreeNode, TextFace


classes = Tree()

#adding 1
course1 = TreeNode(name="Course 1")
face1 = TextFace(text="Course 1")
course1.add_face(face1, column=1)
classes.add_child(child=course1)

#adding 2
course2 = TreeNode(name="Course 2")
face2 = TextFace(text="Course 2")
course2.add_face(face2, column=1)
course1.add_child(child=course2)

#adding 3
course3 = TreeNode(name="Course 3")
face3 = TextFace(text="Course 3")
course3.add_face(face3, column=1)
#adding course3 to 2 parents
course1.add_child(child=course3)
course2.add_child(child=course3)

classes.show()

输出为

我从根本上反对这里有一棵树的想法吗？ ETE有一种简单的（r）方法可以做我提出的建议吗？

如果您需要更多信息，请与我们联系。

Answer 1

我基本上找到了自己问题的答案：我应该使用的数据结构不是树。 @boardrider指出树本身就是一对“结构”，将一个父节点映射到一个或多个子节点。

解决方案是有向无环图。这是图形数据结构的变体，其映射“多对多”以继续从上面的措辞。

资源：

Graph data structure basics

Python specific graph structures

随着我的进步，我会编辑这个。