Question

我正在使用R与SQLite结合使用RSQLite来保存我的数据，因为我没有足够的RAM来持续存储所有列并使用它们进行计算。我使用以下命令在SQLite数据库中添加了一个空列：

dbGetQuery(db, "alter table test_table add column newcol real)

现在我想使用在R中计算的数据来填充此列，该数据存储在我的data.table列dtab $ newcol中。我尝试了以下方法：

dbGetQuery(db, "update test_table set newcol = ? where id = ?", bind.data = data.frame(transactions$sum_year, transactions$id))

不幸的是，R似乎正在做某事但没有使用任何CPU时间或RAM分配。数据库不会改变大小，即使在24小时后也没有任何变化。因此，我认为它已经崩溃 - 没有任何输出。

我使用更新声明错了吗？有没有其他方法可以做到这一点？

更新

我也尝试过RSQLite函数dbSendQuery和dbGetPreparedQuery - 两者结果相同。但是，在不使用bind.data的情况下更新单行的工作原理是什么。因此，更新列的循环似乎是可能的，但我必须评估性能，因为数据集很大。

Answer 1

如@jangorecki所述，问题与SQLite性能有关。我禁用了synchronous并将journal_mode设置为off（必须为每个会话完成）。

dbGetQuery(transDB, "PRAGMA synchronous = OFF") 
dbGetQuery(transDB, "PRAGMA journal_mode = OFF")

此外，我将我的RSQLite代码更改为使用dbBegin()，dbSendPreparedQuery()和dbCommit()。这需要一段时间，但至少它不起作用并具有可接受的性能。