Question

我过去几天一直在使用RDAVIDWebService，今天早上它突然出现以下错误。我在Windows 7计算机上使用R 3.1.1虽然我可以切换到另一台计算机并获得相同的错误。任何人都可以告诉我这个错误意味着什么，为什么它今天出现而不是昨天？尼克

大卫＆LT; -DAVIDWebService $新（电子邮件=＆＃34;用户@研究所＆＃34）
.jcall错误（存根，＆＃34; S＆＃34;，＆＃34;验证＆＃34;，电子邮件）： org.apache.axis2.AxisFault：传输错误：301错误：永久移动

Answer 1

克里斯托瓦尔弗雷斯诺发出了一个解决方案：

解决新的DAVID Web服务配置

1）首先，HTTPS证书需要Java 8才能运行。由于素数大小，以前的版本无法运行。 Java接受的最大大小为1024位。这是一个已知问题（参见JDK-6521495）。

1.1）检查你的java版本 java -version

java版“1.8.0_60” Java（TM）SE运行时环境（版本1.8.0_60-b27） Java HotSpot（TM）64位服务器VM（内置25.60-b23，混合模式）

如果版本是1.7.XX或更早版本，则需要安装Java 8.如果不是，请转到步骤2.

1.2）在Windows中，从oracle网站下载并安装jre或jdk 8

1.2）在linux中按照http://www.webupd8.org/2014/03/how-to-install-oracle-java-8-in-debian.html中的说明操作简而言之，您需要添加webupd8team存储库并安装包：

su - echo“deb http://ppa.launchpad.net/webupd8team/java/ubuntu可信赖的主要”| tee /etc/apt/sources.list.d/webupd8team-java.list echo“deb-src http://ppa.launchpad.net/webupd8team/java/ubuntu可靠主”| tee -a /etc/apt/sources.list.d/webupd8team-java.list apt-key adv --keyserver hkp：//keyserver.ubuntu.com:80 --recv-keys EEA14886 apt-get update apt-get install oracle-java8-installer 出口

2）DAVID使用的实际证书未经Java早午餐认可的权威机构签名。然后，它必须合并到“cacerts”文件才能正确使用它。 2.1）在Windows中：下载cygwin并按照linux说明操作。通常，JRE应安装在JDK的C：\ Program Files \ Java \ jre1.8.0_51 \ lib \ security或C：\ Program Files \ Java \ jdk1.8.0_51 \ jre \ lib \ security中。如有必要，请重新启动计算机。

2.2）在Linux中：获得证书： echo -n | openssl s_client -connect david.ncifcrf.gov:443 | sed -ne'/ -BEGIN CERTIFICATE - /，/ - END CERTIFICATE- / p'＆gt; ncifcrf.cert

检查是否已正确下载： openssl x509 -in ncifcrf.cert -text

备份cacerts文件。在我的例子中，它位于/ etc / ssl / certs / java目录中 sudo cp / etc / ssl / certs / java / cacerts cacerts.org sudo keytool -import -trustcacerts -keystore cacerts -storepass changeit -noprompt -alias david -file ncifcrf.cert

应将证书添加到密钥库。现在，将新的cacerts版本复制到原始位置 sudo cp cacerts / etc / ssl / certs / java /

3）更新R中的Java配置 R CMD javareconf

Java解释器：/ usr / bin / java Java版本：1.8.0_60 Java主路径：/ usr / lib / jvm / java-8-oracle / jre Java编译器：/ usr / bin / javac Java头文件：/ usr / bin / javah Java归档工具：/ usr / bin / jar

4）最后，在RDAVIDWebService中使用新的DAVID Web服务URL

library("RDAVIDWebService")

david<-DAVIDWebService(email="user@email", url="https://david.ncifcrf.gov/webservice/services/DAVIDWebService.DAVIDWebServiceHttpSoap12Endpoint/")
david

#DAVIDWebService object to access DAVID's website. 
#User email:  user@email 
#Available Gene List/s: not submitted yet.

r david webservice突然传输错误：301错误：永久移动

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