尝试与rjags一起使用dmulti时尺寸不匹配

时间:2015-07-15 18:16:06

标签: r jags multinomial r2jags

我正在尝试使用rjags来适应下面的模型,但是我得到了尺寸不匹配错误。该模型在WinBUGS中运行良好,我无法弄清楚如何更改代码。提前感谢您的帮助。

数据:

dataset <- list(n1 = 462, n2 = 537,
                y1 = structure(.Data = c(37, 55, 7, 363), .Dim = c(2, 2)),
                y2 = structure(.Data = c(104, 26, 22, 385), .Dim = c(2, 2)),
                Q = 2)

链的初始值

inits <- list(pi1 = 0.1, pi2 = 0.3, SeMAT = 0.80, SpMAT = 0.90,
              SeCMB = 0.90, SpCMB = 0.9995)

模型

model <- 
'model {
    y1[1:Q, 1:Q] ~ dmulti(p1[1:Q, 1:Q], n1)
    y2[1:Q, 1:Q] ~ dmulti(p2[1:Q, 1:Q], n2)
    p1[1, 1] <- pi1 * SeMAT * SeCMB + (1 - pi1) * (1 - SpMAT) * (1 - SpCMB)
    p1[1, 2] <- pi1 * SeMAT * (1 - SeCMB) + (1 - pi1) * (1 - SpMAT) * SpCMB
    p1[2, 1] <- pi1 * (1 - SeMAT) * SeCMB + (1 - pi1) * SpMAT * (1 - SpCMB)
    p1[2, 2] <- pi1 * (1 - SeMAT) * (1 - SeCMB) + (1 - pi1) * SpMAT * SpCMB
    p2[1, 1] <- pi2 * SeMAT * SeCMB + (1 - pi2) * (1 - SpMAT) * (1 - SpCMB)
    p2[1, 2] <- pi2 * SeMAT * (1 - SeCMB) + (1 - pi2) * (1 - SpMAT) * SpCMB
    p2[2, 1] <- pi2 * (1 - SeMAT) * SeCMB + (1 - pi2) * SpMAT * (1 - SpCMB)
    p2[2, 2] <- pi2 * (1 - SeMAT) * (1 - SeCMB) + (1 - pi2) * SpMAT * SpCMB
    SeMAT ~ dbeta(1, 1) 
    SpMAT ~ dbeta(1, 1) 
    SeCMB ~ dbeta(1, 1)
    SpCMB ~ dbeta(1, 1)
    pi1~ dbeta(1, 1)
    pi2 ~ dbeta(1, 1) 
}'

writeLines(model, 'model.txt')

jags.mod <- jags.model(file = 'model.txt',
                   data = dataset,
                   inits = inits, 
                   n.chains = 3)

错误

jags.model中的错误(file =&#34; model.txt&#34;,data = dataset,inits = inits,:   运行时错误: 无法将节点插入y1 [1:2,1:2]。尺寸不匹配

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

您的意思是指定多变量分布,而不是多项分布吗?

多项分布dmulti有两个参数:n,一个你指定它的整数,pi一个单维向量,总和为一。< / p>

您的p1p2都是多维的,但无法使用该分发。