Question

我有两个文件夹，每个文件夹包含具有相同编号系统的文件，这些文件是文件名的一部分。例如，

文件夹1有：

  001file_read.txt, 002file_read.txt, until 650file_read.txt

文件夹2有：

  001filtr.tsv, 002filtr.tsv, until 650filtr.tsv

我想使用shell脚本运行python代码，它基本上运行如下：

 python my_python_prog.py 001file_read.txt  001filtr.tsv

问题是因为我有两个文件夹的大量文件。我想找到一种方法只运行一次命令，它会自动将file001从folder1运行到file001到folder2，file002从folder1运行到file002从folder2，依此类推，直到两个文件夹的file650。我怎么能用shell脚本呢？

非常感谢您的帮助，

Answer 1

如果你有bash，你可以使用这样的脚本：

#!/bin/bash 

for i in {001..650}; do
    file_read=dir1/${i}file_read.txt
    file_filtr=dir2/${i}filtr.tsv
    if [[ -f $file_read ]] && [[ -f $file_filtr ]]; then
        python my_python_prog.py "$file_read" "$file_filtr"
    fi
done

循环遍历从000到650的所有数字，检查两个文件是否都存在并执行python命令。

如果你没有bash，你可以通过做一些改变来实现同样的目的：

#!/bin/sh

while (( ++i <= 650 )); do
    n=$(printf '%03d' "$i")
    file_read=dir1/${n}file_read.txt
    file_filtr=dir2/${n}filtr.tsv
    if [ -f "$file_read" ] && [ -f "$file_filtr" ]; then
        python my_python_prog.py "$file_read" "$file_filtr"
    fi
done

或者，您可以修改python脚本，在其中执行循环，并使用os.path.isfile()验证两个文件是否存在。这种方法的优点是你不会调用你的脚本650次。

用于运行带有相同编号文件的两个不同文件夹的python代码的Shell脚本

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