Question

我正在尝试安装Platypus并收到以下错误消息：

building 'htslibWrapper' extension
x86_64-linux-gnu-gcc -pthread -fno-strict-aliasing -DNDEBUG -g -fwrapv -O2 -Wall -Wstrict-prototypes -fPIC -I/usr/include/python2.7 -c htslibWrapper.c -o build/temp.linux-x86_64-2.7/htslibWrapper.o -msse2 -msse3 -funroll-loops -D_LARGEFILE64_SOURCE -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -fPIC
htslibWrapper.c:243:25: fatal error: htslib/bgzf.h: No such file or directory
 #include "htslib/bgzf.h"
                         ^
compilation terminated.
error: command 'x86_64-linux-gnu-gcc' failed with exit status 1

我是Bioinformatics的新手，似乎无法在线找到有效的解决方案。

Answer 1

有时，生物信息学应用程序并不能很好地描述它们的依赖关系。有关可能的解决方案，请参阅此link

Answer 2

从http://www.htslib.org/download/安装htslib并将c标头复制到Platypus根文件夹：

cp -r htslib-x.x.x/htslib platypus_folder/

再次建造

Platypus安装错误消息

2 个答案: