我有一个字典,看起来像这样:
{'NM_100': [(0,20), (30,40), (70,90)], 'NM_200': [(0,35), (75,85), (90,100), (200,300)]}
和包含此信息的制表符分隔文件:
isoform strand pos_rein1 pos_rein2
NM_100 - 32 35
NM_100 - 16 16
NM_200 - 76 77
NM_200 - 89 90
我想要做的是测试我的文件中的两个位置是否都在字典中的配对数字范围内。例如,32和35是否位于相同的配对数范围内? (在这种情况下,他们做(30,40))如果他们这样做,继续。如果他们没有(作为我文件中的最后一个案例),请不要继续。这就是我到目前为止所做的:
import csv
with open('indel_mod0_cdsStart_rein_both.txt') as f:
reader = csv.DictReader(f,delimiter="\t")
for row in reader:
pos = row['pos_rein1']
pos2 = row['pos_rein2']
name = row['isoform']
strand = row['strand']
ppos1 = int(pos)
ppos2 = int(pos2)
if name in exons:
y = exons[name]
for i, (low,high) in enumerate(exons[name]):
if low <= ppos1 <= high: #Is there any way to edit this line to test if ppos2 is also in that range
exonnumber = i+1
我目前只是在测试第一个位置是否属于数字范围,是否有一种简单的方法可以解决这个问题以解释这两个数字?
答案 0 :(得分:7)
只需使用and
添加第二个测试:
if low <= ppos1 <= high and low <= ppos2 <= high:
如果您有更多的职位要测试,您可以切换到使用all()
,并将这些职位存储在一个序列中(此处称为positions
):
if all(low <= pos <= high for pos in positions):