如何在读取CSV文件时捕获`CParserError`

时间:2015-07-06 11:57:59

标签: python python-3.x pandas

我想将CSV列表读入数据帧。但是,我在捕获文件具有与数据本身不匹配的标题行(即元数据或其他空行)时发生的错误时遇到问题。此错误是'CParserError'(请参阅底部的错误消息)。

我目前的解决方案是使用带有

的try-except语句
try:
    #read file
except CParserError:
    #give me an error message

然而,这失败并出现以下错误:

NameError: name 'CParserError' is not defined

我的代码如下。正如您所看到的,我认为我需要多个except语句来捕获各种错误。第一个应检查默认编码类型是否有效(文件永远不会是utf-8或latin-1以外的任何文件)。如果有标题行,pd.read_csv会给出一个'CParserError'消息(见下文),我需要捕获它。然后,如果还有其他杂项问题,我也想抓住这些问题。

任何欢迎的解决方案,理想情况下都可以解释为什么CParserError不正确,或者是否可以修改try-except逻辑以避免依赖它。

感谢。

files_list = glob.glob('*.csv*')     #get all csvs
files_dict = {}           
for file in files_list:
    try:
        files_dict[file] = pd.read_csv('DFA_me_week27.csv', encoding='utf-8').read() 
    except UnicodeDecodeError:    
        files_dict[file] = pd.read_csv('DFA_me_week27.csv', encoding='Latin-1').read()
    except CParserError:
        print(file, 'failed: check for header rows')
    except:
        print(file, 'failed: some other error occurred')

尝试使用标头解析CSV文件时出现错误消息:

CParserError                              Traceback (most recent call last)
<ipython-input-15-e454c053d675> in <module>()
----> 1 pd.read_csv('DFA_me_week27.csv')

C:\Users\john.lwli\AppData\Local\Continuum\Anaconda3\lib\site-packages\pandas\io\parsers.py in parser_f(filepath_or_buffer, sep, dialect, compression, doublequote, escapechar, quotechar, quoting, skipinitialspace, lineterminator, header, index_col, names, prefix, skiprows, skipfooter, skip_footer, na_values, na_fvalues, true_values, false_values, delimiter, converters, dtype, usecols, engine, delim_whitespace, as_recarray, na_filter, compact_ints, use_unsigned, low_memory, buffer_lines, warn_bad_lines, error_bad_lines, keep_default_na, thousands, comment, decimal, parse_dates, keep_date_col, dayfirst, date_parser, memory_map, float_precision, nrows, iterator, chunksize, verbose, encoding, squeeze, mangle_dupe_cols, tupleize_cols, infer_datetime_format, skip_blank_lines)
    463                     skip_blank_lines=skip_blank_lines)
    464 
--> 465         return _read(filepath_or_buffer, kwds)
    466 
    467     parser_f.__name__ = name

C:\Users\john.lwli\AppData\Local\Continuum\Anaconda3\lib\site-packages\pandas\io\parsers.py in _read(filepath_or_buffer, kwds)
    249         return parser
    250 
--> 251     return parser.read()
    252 
    253 _parser_defaults = {

C:\Users\john.lwli\AppData\Local\Continuum\Anaconda3\lib\site-packages\pandas\io\parsers.py in read(self, nrows)
    708                 raise ValueError('skip_footer not supported for iteration')
    709 
--> 710         ret = self._engine.read(nrows)
    711 
    712         if self.options.get('as_recarray'):

C:\Users\john.lwli\AppData\Local\Continuum\Anaconda3\lib\site-packages\pandas\io\parsers.py in read(self, nrows)
   1157 
   1158         try:
-> 1159             data = self._reader.read(nrows)
   1160         except StopIteration:
   1161             if nrows is None:

pandas\parser.pyx in pandas.parser.TextReader.read (pandas\parser.c:7403)()

pandas\parser.pyx in pandas.parser.TextReader._read_low_memory (pandas\parser.c:7643)()

pandas\parser.pyx in pandas.parser.TextReader._read_rows (pandas\parser.c:8260)()

pandas\parser.pyx in pandas.parser.TextReader._tokenize_rows (pandas\parser.c:8134)()

pandas\parser.pyx in pandas.parser.raise_parser_error (pandas\parser.c:20720)()

CParserError: Error tokenizing data. C error: Expected 2 fields in line 12, saw 12

3 个答案:

答案 0 :(得分:6)

我讨厌陈述明显的,但......

from pandas.parser import CParserError

FutureWarning:pandas.parser模块已弃用,将在以后的版本中删除。请改用以下内容

import from the pandas.io.parser

答案 1 :(得分:1)

我用 from pandas.parser import CParserError 我得到了 FutureWarning: The pandas.parser module is deprecated and will be removed in a future version. Please import from the pandas.io.parser instead 所以 from pandas.io.parser import CParserError 被推荐。

我使用的是Python 3.6,而我的pandas版本是0.20.3

然而,当我使用from pandas.io.parser import CParserError时,我得到了 ModuleNotFoundError: No module named 'pandas.io.parser'

答案 2 :(得分:0)

如果你的导入pandas为pd,你可以像这样的错误(pandas 0.19):

except pd.parser.CParserError: