Question

我有file个包含表格的行

double mass, string seq, int K, int TS, int M, [variable number of ints]
688.83       AFTDSK      1      1       0       3384 2399 1200
790.00       MDSSTK      1      3       1       342 2

我需要一种（最好是简单的）方法来解析这个文件而不需要提升。如果每行的值数量不变，那么我会使用解here。

每一行都将成为Peptide类的对象：

class Peptide {
    public:
        double mass;
        string sequence;
        int numK;
        int numPTS;
        int numM;
        set<int> parents;
 }

前三个整数在对象中有特定的变量名，而所有以下整数都需要插入一个集合中。

我很幸运能得到两个非常棒的回复，但运行时差异使C实现成为我的最佳答案。

Answer 1

如果要使用C ++，请使用C ++：

std::list<Peptide> list;
std::ifstream file("filename.ext");

while (std::getline(file, line)) {

    // Ignore empty lines.
    if (line.empty()) continue;

    // Stringstreams are your friends!
    std::istringstream row(line);

    // Read ordinary data members.
    Peptide peptide;
    row >> peptide.mass
        >> peptide.sequence
        >> peptide.numK
        >> peptide.numPTS
        >> peptide.numM;

    // Read numbers until reading fails.    
    int parent;
    while (row >> parent)
        peptide.parents.insert(parent);

    // Do whatever you like with each peptide.
    list.push_back(peptide);

}

Answer 2

我知道解析ascii文本文件的最好方法是逐行读取并使用strtok。这是一个C函数，但它会打破你对个人令牌的输入。然后，您可以使用字符串解析函数atoi和strtod来解析数值。对于您指定的文件格式，我会执行以下操作：

  string line;
  ifstream f(argv[1]);
  if(!f.is_open()) {
    cout << "The file you specified could not be read." << endl;
    return 1;
  }

  while(!f.eof()) {
    getline(f, line);
    if(line == "" || line[0] == '#') continue;

    char *ptr, *buf;
    buf = new char[line.size() + 1];
    strcpy(buf, line.c_str());

    Peptide pep;
    pep.mass     = strtod(strtok(buf, " "), NULL);
    pep.sequence = strtok(NULL, " ");
    pep.numK     = strtol(strtok(NULL, " "), NULL, 10);
    pep.numPTS   = strtol(strtok(NULL, " "), NULL, 10);
    pep.numM     = strtol(strtok(NULL, " "), NULL, 10);
    while(ptr = strtok(NULL, " "))
      pep.parents.insert(strtol(ptr, NULL, 10));

    cout << "mass: " << mass << endl
         << "sequence: " << sequence << endl
         << "numK: " << numK << endl
         << "numPTS: " << numPTS << endl
         << "numM: " << numM << endl
         << "parents:" << endl;

    set<int>::iterator it;
    for(it = parents.begin(); it != parents.end(); it++)
      cout << "\t- " << *it << endl;
  }
  f.close();

使用C或C ++中的可变数量的条目解析一行（无增强）

2 个答案: