所以,我使用链接上给出的步骤安装了SparkR:" https://amplab-extras.github.io/SparkR-pkg/"。我已经使用网站上提供的直接命令从Github存储库安装了它。现在,这里是我的代码:
library(SparkR)
sc <- sparkR.init(master="local")
files <- paste0("NP",1:10,".txt")
func.clique <- function(file)
{
w <- read.table(file)
g <- graph.edgelist(cbind(as.character(w$V1),as.character(w$V2)))
plot(g)
cli <- cliques(g)
return (cli)
}
includePackage(sc, igraph)
cliquevalues <- sapply(files,func.clique)
现在,当我直接使用igraph
库时,此代码可以正常工作(在RStudio中没有SparkR命令)。但现在,当我执行它时,它会说Error in FUN(X[[i]], ...) : could not find function "graph.edgelist"
。可能的原因是什么?我曾尝试将includePackage
放在几个地方,但似乎没有任何帮助。请帮忙!谢谢。
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我会尝试将library(igraph)
放在闭包函数中,以及其他不属于基本包的库。类似的东西:
func.clique <- function(file) {
library(igraph)
w <- read.table(file)
g <- graph.edgelist(cbind(as.character(w$V1),as.character(w$V2)))
plot(g)
cli <- cliques(g)
return (cli)
}