我正在使用cython代码来加速一个纯粹的python计算的瓶颈。我在一个长度为Lbox的周期性盒子中有一对点(对于这个问题,1d情况很好)。我需要计算y-x的符号,当周期性边界条件有效时我需要翻转这个符号。
在没有PBC的情况下,以下问题提供了解决方案:Is there a standard sign function (signum, sgn) in C/C++?。该解决方案是我用来计算 sgn 函数的方法。
def sgn(x, y):
""" If x > y, returns 1.
If x < y, returns -1.
If x == y, returns 0.
"""
return (y < x) - (x < y)
下面写的 sgn_pbc 函数返回正确的结果,但编写效率低: sgn_pbc 中的控制流是减缓PBC版本的罪魁祸首。如何以与 sgn 函数类似的方式编写 sgn_pbc ,以避免笨拙的控制流程?
def sgn_pbc(x, y, Lbox):
d = abs(x-y)
if d <= Lbox/2.:
return sgn(x, y)
else:
return -1*sgn(x, y)
答案 0 :(得分:1)
首先,
-1*sgn(x, y) == sgn(y, x)
然后,
def sgn_pbc(x, y, Lbox):
d = abs(x-y)
if d <= Lbox/2.:
return sgn(x, y)
else:
return sgn(y, x)
同样在Python中,函数调用是最昂贵的操作。您可以内联sgn
。
def sgn_pbc(x, y, Lbox):
d = abs(x-y)
if d <= Lbox/2.:
return (y < x) - (x < y)
else:
return (x < y) - (y < x)
但是if
可以(大部分)重写为:
def sgn_pbc(x, y, Lbox):
d = abs(x-y)
w = sgn(Lbox/2., d)
return w * sgn(x, y)
再次,内联sgn
,
def sgn_pbc(x, y, Lbox):
d = abs(x-y)
w = sgn(Lbox/2., d)
return w * (y < x) - (x < y)
我主要是因为d == Lbox/2.
这会返回错误的值。
但是还没有计时。