Question

请原谅我，我是Java的新手。这是我目前的计划的一部分。在这里，我正在读取一个.txt文件，并将该文件的某些行添加到arrayList（它应该正常工作）：

 public void actionPerformed(ActionEvent e) {

    ArrayList<String> organismsString = new ArrayList<String>();
    boolean printLines = false;
    StringBuilder organism = new StringBuilder();
    if (e.getSource() == openButton) {
        returnVal = fileChooser.showOpenDialog(null);
        if (returnVal == JFileChooser.APPROVE_OPTION) {
            file = fileChooser.getSelectedFile();
            //File[] file = hairpinFileChooser.getSelectedFiles();
            //read file
            try {
                br = new BufferedReader(new FileReader(
                    while ((currentLine = br.readLine()) != null) {
                        if (printLines) {
                            if (currentLine.startsWith(">")) {
                                // We have reached the next organism, so stop printing
                                printLines = false;
                                // Add the current organism to our collection

                                organismsString.add(organism.toString());


                                // Clear the StringBuilder, ready for the next organism
                                organism.setLength(0);

                            } else {
                                // We are still printing the current organism
                                organism.append(currentLine);

                            } 
                        } 

                        if (currentLine.startsWith(organismId)) {
    // Print this line, and start printing all lines after this (we don't want to append the current line)
                            //organism.append(currentLine);
                            printLines = true;

                        }  
                    }  
                    //Adds the final organism in the .txt file
                    organismsString.add(organism.toString());

但是现在我想要计算arrayList的每个元素中字母“G”和“C”的频率。

目前，我可以计算ArrayList中所有字母的频率，但不能计算特定字母的频率，也不能计算每个单独元素的频率。我必须实现的代码如下：

 char [] c = organism.toString().toCharArray();
                            int sz = c.length;
                            int i = 0, j = 0, counter = 0;

                            for (i = 0; i < sz; i++) {
                                counter = 0;
                                for(j=0; j<sz; j++) {
                                    if( j<i && c[i] == c[j]) {
                                        break;
                                    }
                                    if (c[j] == c[i]) {
                                        counter++;
                                    }
                                    if(j == sz-1) {
                                    System.out.println("character " + c[i]+ " is present" +counter+" times");
                                    }
                                }

                            }

如果有人对我如何能够实现这一目标有任何帮助或建议，那将非常感激！

希望这一切都有意义，但如果不是，请问任何问题！

非常感谢：）

Answer 1

你可以有两个int变量，一个用于Cs的数量，一个用于Gs的数量。然后，依次遍历char数组中的元素。如果当前元素等于C，则递增C计数器。如果它等于G，则递增G计数器。

如果您只想要Gs和Cs的总数，那么每次遇到G或C时都要有一个计数器并递增。

Answer 2

我认为有两种可能的方法。

循环遍历字符串中的每个字符，并在遇到“C＆＃39; C＆＃39;或者＆＃39; G＆＃39;。您不必将String转换为char []来迭代字符，只需使用String.charAt()。
使用＆＃34; [^ CG]＆＃34;的正则表达式模式执行临时String.replaceAll()这意味着您要替换所有不是C＆＃39; C＆＃39;或者＆＃39; G＆＃39;用和空字符串。这将产生一个只有C和G的字符串，您可以调用String.length()。

示例代码：

public static void main(String[] args) throws Exception {
    String data = "GGGGGCABCKDJ930495860CCCGCGCGCCCGG";

    // Loop counting
    int cgCount = 0;
    for (int i = 0; i < data.length(); i++) {
        if (data.charAt(i) == 'C' || data.charAt(i) == 'G') {
            cgCount++;
        } 
    }

    System.out.printf("CG Count: %d\r\n", cgCount);
    // String.replaceAll with regex pattern
    System.out.printf("CG Count: %d\r\n", data.replaceAll("[^CG]", "").length());
}

结果：

CG Count: 20
CG Count: 20

获取ArrayList <string>的每个元素中存在的特定字符的频率

2 个答案: