如何在Cray XC上编译VASP 5.3.5?

时间:2015-06-25 13:18:52

标签: compilation linear-algebra cray

我需要在Cray XC MPP机器上编译VASP 5.3.5。该系统具有Gnu,Intel和Cray编译环境。 BLAS,LAPACK,ScaLAPCK还可以选择英特尔MKL或Cray LibSci。

哪种编译器使用最好,使用最好的数值库和Makefile选项?

1 个答案:

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对ARCHER(http://www.archer.ac.uk)的测试表明,在英特尔MKL和FFTW上使用英特尔编译器可在Cray XC30系统上产生最佳性能和最稳定的VASP 5.3.5版本。

完整的编译说明可在以下网址找到:

http://www.archer.ac.uk/documentation/software/vasp/compiling_5-3-5-phase2.php

简而言之,程序是:

module swap PrgEnv-cray PrgEnv-intel
module load fftw
module load cray-pe-hugepages2M

修改库makefile以具有以下选项:

CPP     = gcc -E -P -C $*.F >$*.f
FC=ftn 
CFLAGS = -O3
FFLAGS = -O3 -unroll -ip -no-prec-div -xAVX
FREE   = -free

构建库(假设makefile被调用" makefile.cray_xc_intel.lib"):

cd vasp.5.lib
make -f makefile.cray_xc_intel.lib

转到主要源代码目录:

cd ../vasp.5.3

在Makefile中设置预处理器选项(这适用于多个K点版本):

CPP    = $(CPP_) -DMPI -DHOST=\"CrayXC-Intel\" \
         -DNGZhalf \
         -DLONGCHAR \
         -Dkind8 \
         -DCACHE_SIZE=2000 \
         -Davoidalloc \
         -DRPROMU_DGEMV  \
         -DMPI_BLOCK=100000 \
         -Duse_collective \
         -Drandom_array \
         -DscaLAPACK

设置makefile编译选项:

FC=ftn
FCL=$(FC)

CPP_ = ./preprocess <$*.F | cpp -P -C -traditional >$*$(SUFFIX)

FFLAGS = -free -march=corei7-avx -assume byterecl  -m64

OFLAG  = -O3 -ip -fno-alias -unroll-aggressive -opt-prefetch -use-intel-optimized-headers -no-prec-div

OFLAG_LOW = -O1 -g -ftz
OBJ_LOW = broydon.o

为英特尔MKL设置makefile线性代数库选项:

MKL_PATH = $(MKLROOT)/lib/intel64
BLAS=
LAPACK=
BLACS=
SCA=

LIB  = ../vasp.5.lib/linpack_double.o -L../vasp.5.lib -ldmy \
        ${MKL_PATH}/libmkl_blas95_lp64.a ${MKL_PATH}/libmkl_lapack95_lp64.a \
        ${MKL_PATH}/libmkl_scalapack_lp64.a  \
        -Wl,--start-group ${MKL_PATH}/libmkl_intel_lp64.a \
        ${MKL_PATH}/libmkl_sequential.a ${MKL_PATH}/libmkl_core.a \
        ${MKL_PATH}/libmkl_blacs_intelmpi_lp64.a  -Wl,--end-group -lpthread -lm

最后,设置用于链接FFTW的makefile选项:

FFT3D   = fftmpiw.o fftmpi_map.o fftw3d.o fft3dlib.o

现在构建代码(假设makefile被调用&#34; makefile.cray_xc_intel&#34;):

make -f makefile.cray_xc_intel