Question

我在使用scipy提供的mannwhitneyu测试时遇到了一些麻烦。我认为我的问题在于导入。这是我的剧本：

SNPs=[]
Nonsense=[]

with open("final_positions_SNP_removed_duplicates_truepos_truetrans_normalized.txt") as fd:
    fd.readline()
    for line in fd:
        SNPs.append(line.split()[8])

with open("final_positions_nonsense_truepos_truetrans_normalized.txt") as fd:
    fd.readline()
    for line in fd:
        Nonsense.append(line.split()[8])

from scipy import stats
from scipy.stats import mannwhitneyu
u_value, p_value = scipy.stats.mannwhitneyu(SNPs, Nonsense)

我一直收到错误消息：NameError: name 'scipy' is not defined我想我需要导入scipy，但是如何？

Answer 1

from scipy.stats import mannwhitneyu
u_value, p_value = scipy.stats.mannwhitneyu(SNPs, Nonsense)

您已导入mannwhitneyu，因此您应该使用

u_value, p_value = mannwhitneyu(SNPs, Nonsense)

您获得NameError: name 'scipy' is not defined的原因是您没有导入scipy，您只导入了scipy的模块。要导入scipy本身，你必须这样做：

import scipy

苦苦挣扎从scipy导入模块

1 个答案: