我正在尝试绘制我针对一系列值(y轴与x轴)创建的函数。
我想要计算的操作在"矩阵乘法"中是常见的。 :
r^T * C * r
其中r ^ T的形状为(1,100)
,r为形状(100,1)
,C为形状(100,100)
的矩阵(或ndarray形状100,100)。使用numpy.dot()
相乘,输出应为单个值。
该函数只有一个输入,可以是一个数组。
import numpy as np
# The user first sets the values used by the function
# Not "true code", because input() too complex for the question at hand
r = data # an numpy ndarray of 100 values, (100,)
original_matrix = M # set matrix, such that M.shape = (100, 100)
param = array of data # EITHER an array of values, shape (50,),
# OR one value, i.e. a 32/64-bit float
# e.g. parameters = np.array of 50 values
def function(param):
# using broadcasting, "np.sum(param * original_matrix for i in r)"
new_matrix = np.sum(param[:, None, None] * original_matrix, axis=0)
# now perform r^T * C * r
return np.dot( r.transpose(), np.dot( new_matrix, r) )
调用函数
function(param)
会产生一个值,格式为= numpy.float64
。
我想针对一系列值绘制此函数,即我需要此函数输入np.array并输出np.cdarray,必须与ufuncs
中的其他NumPy
一样。该函数将评估ndarray中的每个元素,并将其绘制为函数。
例如,
import pylab
X = np.arange(100)
Y = sin(X)
pylab.plot(X, Y)
输出
鉴于我的原始函数(仅仅是数组的函数"参数")会产生np.float64
格式,如何将此函数转换为ufunc
?我想在y轴上绘制我的函数,而不是x轴上的参数。
答案 0 :(得分:0)
如果将函数更改为使用单个参数而不是数组,该怎么办?
然后你可以做
X = range(50)
Y = [function(x) for x in X]
pylab.plot(X, Y)
答案 1 :(得分:0)
我可以提供两种解决方案
您可以使用处理数字的ufunc
以及np.vectorize
函数
np.sin
函数
def my_func_1(param):
# using broadcasting, "np.sum(param * original_matrix for i in r)"
new_matrix = np.sum(param * original_matrix[None,:,:], axis=0)
# now perform r^T * C * r
return np.dot( r.transpose(), np.dot( new_matrix, r) )
my_vec_func_1 = np.vectorize(my_func_1)
请注意np.vectorize
并没有真正向量化代码...如果数组作为参数传递,我只会自动生成for
循环。使用它没有在运行时获得...请参阅下面的时间。
您可以定义一个真正的矢量化函数,该函数采用(对于以下代码)仅一维列表或np.arrays
作为参数:
def my_vec_func_2(param):
param = np.asarray(param)
new_matrix = np.sum(param[:,None,None,None] * original_matrix[None,None,:,:],axis=1)
return np.dot(r, np.dot(new_matrix,r).transpose())
真正的矢量化代码通常比for
循环快得多。为什么在这种情况下收益如此之小,我无法解释这个案例......
<强>计时强>
我使用以下代码来测试运行时
import numpy as np
from numpy.random import randint
r = randint(10,size=(100)) # an numpy ndarray of 100 values, (100,)
original_matrix = randint(30,size=(100,100))
timeit my_vec_func_1(np.arange(10000))
1 loops, best of 3: 508 ms per loop
timeit my_vec_func_2(np.arange(10000))
1 loops, best of 3: 488 ms per loop
timeit [my_func_1(x) for x in np.arange(10000)]
1 loops, best of 3: 505 ms per loop