matplotlib中包含大量数据点的数字

Question

我使用matplotlib（png格式）生成附加图像。我想使用eps或pdf，但我发现，对于所有数据点，图形在屏幕上渲染的速度非常慢。除了绘制较少的数据之外，还有优化它以便加载更快吗？

Answer 1

我认为你有三种选择：

1. 正如您自己提到的，您可以减少积分。对于你在问题中显示的情节，我认为只绘制其他每一点都可以。

2. 正如@tcaswell在评论中所说，你可以使用一条线代替点，这样可以提高效率。

3. 你可以光栅化蓝点。 Matplotlib允许您有选择地栅格化单个艺术家，因此如果您将rasterized=True传递给绘图命令，您将获得输出文件中点的位图版本。由于位图的分辨率，以有限缩放的价格加载会更快。 （请注意，绘图的轴和所有其他元素将保留为矢量图形和字体元素。）

Answer 2

首先，如果你想在你的绘图中显示一个“趋势”，并考虑你正在绘制的x，y数组是“巨大的”，你可以将随机的子采样应用到你的x，y数组，作为一个分数你的数据：

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt

fraction = 0.50
x_resampled = []
y_resampled = []

for k in range(0,len(x)):
   if np.random.rand() < fraction:
       x_resampled.append(x[k])
       y_resampled.append(y[k])

plt.scatter(x_resampled,y_resampled , s=6)
plt.show()

其次，您是否考虑过在x轴上使用对数刻度来提高可见度？

Answer 3

在这个例子中，只有绘图区域被光栅化，轴仍然是矢量格式：

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
x = np.random.uniform(size=400000)
y = np.random.uniform(size=400000)
plt.scatter(x, y, marker='x', rasterized=False)
plt.savefig("norm.pdf", format='pdf')